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    PDCD7系列程序性细胞死亡7[智人（人类）]

    基因ID:10081，更新日期2024年3月5日

    总结

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    官方符号
    PDCD7系列由提供HGNC公司
    官方全名
    程序性细胞死亡7由提供HGNC公司
    主要来源
    HGNC:HGNC:8767
    请参阅相关
    乐团：ENSG0000090470 MIM:608138； 联盟基因组：HGNC:8767
    基因类型
    蛋白质编码
    RefSeq状态
    检验过的
    有机体
    智人
    血统
    真核生物；后生动物；脊索动物；颅亚目；脊椎动物；真造口术；哺乳动物；Eutheria；尤阿古托格利尔斯；灵长类；Haplorhini；卡塔里尼；人科；人类
    也称为
    59K；ES18；赫斯18
    总结
    该基因编码一个与U11小核核糖核蛋白（snRNP）相关的59kDa蛋白，snRNP是负责催化U12型内含子前mRNA剪接的小U12型剪接体的组成部分。[由RefSeq提供，2010年12月]
    表达式
    睾丸（RPKM10.7）、卵巢（RPKM7.3）和25个其他组织中普遍表达查看更多
    直系同源
    鼠标 全部的
    新款
    尝试新的基因表
    尝试新的成绩单

    基因组背景

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    位置：
    15季度22.31
    外显子计数：
    5
    注释发布 状态 装配 Chr公司 位置
    2003年10月10日 现在的 GRCh38.p14型(GCF_000001405.40) 15 NC_000015.10（65117379..65133808，补码）
    2003年10月10日 现在的 T2T-CHM13v2.0(GCF_009914755.1号) 15 NC_060939.1（62926802..62943229，补码）
    105.20220307 上一个程序集 GRCh37.p13型(合同通用条款000001405.25) 15 NC_000015.9（65409717..65426146，补充）

    染色体15-NC_000015.10描述邻近基因的基因组背景 Neighboring gene kelch repeat and BTB domain containing 13 Neighboring gene H3K27ac-H3K4me1 hESC enhancer GRCh37_chr15:65377155-65377680 Neighboring gene H3K4me1 hESC enhancer GRCh37_chr15:65378209-65378734 Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid active region 9592 Neighboring gene H3K4me1 hESC enhancer GRCh37_chr15:65379400-65380041 Neighboring gene H3K4me1 hESC enhancer GRCh37_chr15:65385262-65385762 Neighboring gene H3K4me1 hESC enhancer GRCh37_chr15:65386379-65386880 Neighboring gene ubiquitin associated protein 1 like Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid silent region 6551 Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid silent region 6552 Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid active region 9593 Neighboring gene caseinolytic mitochondrial matrix peptidase chaperone subunit X Neighboring gene NANOG-H3K27ac hESC enhancer GRCh37_chr15:65477313-65478197 Neighboring gene uncharacterized LOC124903509

    基因组区域、转录物和产物

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    表达式

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    • 项目名称：HPA RNA-seq正常组织
    • 描述：对代表27种不同组织的95名人类个体的组织样本进行RNA-seq，以确定所有蛋白编码基因的组织特异性
    • 生物项目：项目编号：4337
    • 出版物：项目管理标识号24309898
    • 分析日期：2018年4月4日星期三07:08:55

    参考文献

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    PubMed中的相关文章

    1. H9N2聚合酶复合物的聚合酶酸性亚基通过与A549细胞中的PDCD7结合诱导细胞凋亡。 王S，等Virol J，2021年4月13日。PMID 33849599，免费PMC文章
    2. 脑源性人类免疫缺陷病毒-1 Tat对LTR反式激活和神经免疫激活具有不同的作用。 博文洛杉矶，等神经病毒学杂志，2007年4月，PMID 17505986
    3. miR-134靶向PDCD7以减少E-钙粘蛋白的表达并增强口腔癌的进展。 彭SY，等《国际癌症杂志》，2018年12月1日。PMID 29971778号
    4. 急性髓细胞白血病预后评估新分子标记物的鉴定：PDCD7、FIS1和Ang2的过度表达可能表明急性髓细胞性白血病预处理患者预后不良。 田毅，等《公共科学图书馆·综合》，2014年。PMID 24416201，免费PMC文章
    5. U11-48K蛋白与U12型内含子的5’剪接位点和U11-59K蛋白接触。 图伦·JJ，等《分子细胞生物学》，2008年5月，PMID 18347052，免费PMC文章

    查看PubMed中的所有（38）条引文

    GeneRIFs：功能的基因引用

    什么是GeneRIF？
    1. H9N2聚合酶复合物的聚合酶酸性亚基通过与A549细胞中的PDCD7结合诱导细胞凋亡。
      标题：H9N2聚合酶复合物的聚合酶酸性亚基通过与A549细胞中的PDCD7结合诱导细胞凋亡。
    2. FIS1和PDCD7的表达被认为是独立的危险因素，应纳入当前的急性髓细胞白血病分层系统
      标题：急性髓细胞白血病中FIS1、SPI1、PDCD7和Ang2表达水平的临床和预后意义。
    3. 在OSCC肿瘤组织中观察到PDCD7和E-cad的下调以及miR-134的高水平表达。
      标题：miR-134以PDCD7为靶点，减少E-cadherin的表达并促进口腔癌的进展。
    4. PDCD7、Ang2和FIS1可能提示急性髓细胞白血病的侵袭性更强，预后较差。
      标题：急性髓细胞白血病预后评估新分子标记物的鉴定：PDCD7、FIS1和Ang2的过度表达可能表明急性髓细胞性白血病预处理患者预后不良。
    提交： 新GenerRIF 更正

    表型

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    在NIH基因检测注册中心（GTR）查找该基因的测试

    使用PheGenI回顾该区域的eQTL和表型关联数据

    变更

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    参见ClinVar中的变量

    参见dbVar中的研究和变体

    参见变体查看器（GRCh37.p13）

    参见变体查看器（GRCh38）

    基因型

    PubChem的途径

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    互动

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    产品 交互作用者 其他基因 复杂 来源 酒吧 描述

    一般基因信息

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    标记

    同源性

    克隆名称

    • FLJ54213，MGC22015

    基因本体论 GOA提供

    过程 证据代码 酒吧
    参与RNA剪接 集成电路
    馆长推断
    更多信息
    		 公共医学 
    参与凋亡过程 国际能源署
    从电子注释推断
    更多信息
    		  
    参与糖皮质激素反应 国际空间站
    根据序列或结构相似性推断
    更多信息
    		 公共医学 
    组件 证据代码 酒吧
    U12型剪接体复合体的一部分 国际律师协会
    从祖先的生物学角度推断
    更多信息
    		  
    U12型剪接体复合体的一部分 国际开发协会
    根据直接分析推断
    更多信息
    		 公共医学 
    核质定位 TAS公司
    可追溯作者声明
    更多信息
    		  

    一般蛋白质信息

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    首选名称
    程序性细胞死亡蛋白7
    姓名
    U11/U12 snRNP 59K
    凋亡相关蛋白ES18

    NCBI参考序列（RefSeq）

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    新款 尝试新的成绩单

    独立于注释的RefSeq维护基因组

    这些参考序列独立于基因组构建而存在。解释

    这些参考序列与基因组无关注释循环，因此其版本可能与当前的RefSeq版本不匹配基因组构建。通过比较中RefSeq的版本来确定版本不匹配本节至中报告的那一节基因组区域，成绩单和产品以上。

    mRNA和蛋白质

    1. NM_005707.2号→NP_005698.1号程序性细胞死亡蛋白7

      参见NP_005698.1的相同蛋白质及其注释位置

      状态：已审阅

      源序列
      AC013553、AK096970、BC016992
      共识CDS
      CCDS10201.1号文件
      UniProtKB/Swiss-Prot公司
      问题8N8D1,问题96AK8,Q9Y6D7期
      UniProtKB/TrEMBL公司
      第6页3
      相关的
      ENSP00000204549.4号文件,ENST00000204549.9
      保守领域（1）总结
      pfam16021型
      位置：191→481
      PDCD7；程序性细胞死亡蛋白7

    注释基因组的参考序列：GCF_000001405.40-RS_2023_10

    以下部分包含属于特定基因组构建。解释

    参考GRCh38.p14一次组件

    基因组学

    1. NC_000015.10参考GRCh38.p14初级组件

      范围
      65117379..65133808补码
      下载
      GenBank（基因银行）,美国金融服务贸易协会,序列查看器（图形）

    备选T2T-CHM13v2.0

    基因组学

    1. NC_060939.1替代T2T-CHM13v2.0

      范围
      62926802..62943229补码
      下载
      GenBank（基因银行）,美国金融服务贸易协会,序列查看器（图形）
    核苷酸 蛋白质
    标题 加入和版本
    蛋白质接入 链接
    GenPept链接 UniProtKB链接
    问题8N8D1.1 GenPept公司 UniProtKB/Swiss-Prot:Q8N8D1

    基因链接输出

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