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    卡尔钙网蛋白[褐家鼠(挪威鼠)]

    基因ID:64202,更新日期2024年4月11日

    总结

    官方符号
    卡尔由提供RGD公司
    官方全名
    钙网蛋白由提供RGD公司
    主要来源
    RGD:620288
    请参阅相关
    乐团:ENSRNOG00000003029 联盟基因组:RGD:620288
    基因类型
    蛋白质编码
    RefSeq状态
    已验证
    有机体
    褐家鼠
    血统
    真核生物;后生动物;脊索动物;克兰亚塔;脊椎动物;真造口术;哺乳动物;Eutheria;尤阿古托格利尔斯;闪光;啮齿动物;肌形态;鼠形目;鼠科;穆里奈;大鼠
    总结
    实现多种功能,包括激素结合活性;金属离子结合活性;和肽结合活性。参与多种过程,包括细胞对锂离子的反应;雌二醇反应;以及对睾酮的反应。位于多种细胞成分中,包括顶体小泡;内质网;细胞质的核周区。蛋白质复合物的一部分。维生素B12缺乏的生物标志物。与原发性血小板增多症相关的该基因的人类同源基因;骨髓纤维化;胰腺导管腺癌;铁粒细胞性贫血;和血小板增多症。与人类CALR同源(钙网蛋白)。【由基因组资源联盟提供,2022年4月】
    表达式
    肝脏(RPKM 2967.5)、肾脏(RPKM2083.5)和9个其他组织中的偏倚表达查看更多
    直系同源
    新款
    尝试新的基因表
    尝试新的成绩单表

    基因组背景

    位置:
    2011年第19季度
    外显子计数:
    9
    注释发布 状态 装配 Chr公司 位置
    RS_2024_02号 现在的 GRCr8级(GCF_036323735.1号) 19 NC_086037.1(40213367..40218262)
    RS_2023_06号 上一个程序集 额定BN7.2(GCF_015227675.2号) 19 NC_051354.1(23308525..23313420)
    106 上一个程序集 雷诺_6.0(GCF_ 000001895.5) 19 NC_005118.4(25956771..25961666,补体)

    染色体19-NC_086037.1描述邻近基因的基因组背景 Neighboring gene glutaryl-CoA dehydrogenase Neighboring gene synaptonemal complex central element protein 2 Neighboring gene phenylalanyl-tRNA synthetase subunit alpha Neighboring gene RAD23 homolog A, nucleotide excision repair protein Neighboring gene GADD45G interacting protein 1 Neighboring gene DAN domain BMP antagonist family member 5 Neighboring gene uncharacterized LOC134483324

    基因组区域、转录物和产物

    表达式

    • 项目名称:跨越11个器官和4个发育阶段的大鼠RNA-Seq转录体BodyMap
    • 描述:从Fischer 344大鼠的11个器官(肾上腺、大脑、心脏、肾脏、肝脏、肺、肌肉、脾脏、胸腺和睾丸或子宫)中分离出320个RNA样本,这些器官来自于四个发育阶段(2-、6-、21-和104周龄)的雌雄大鼠
    • 生物项目:项目编号:238328
    • 出版物:PMID 24510058
    • 分析日期:2016年6月6日星期一17:44:12

    参考文献

    GeneRIFs:功能的基因引用

    什么是GeneRIF?

    PubChem的途径

    互动

    产品 交互作用剂 其他基因 复杂 来源 酒吧 描述

    一般基因信息

    基因本体论 RGD提供

    功能 证据代码 酒吧
    使钙离子结合 国际律师协会
    从祖先的生物学角度推断
    更多信息
     
    使钙离子结合 国际开发协会
    根据直接分析推断
    更多信息
    公共医学 
    使钙离子结合 国际能源署
    从电子注释推断
    更多信息
     
    使钙离子结合 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    使碳水化合物结合 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    启用补码组件C1q复合绑定 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    启用激素结合 IPI公司
    从物理相互作用推断
    更多信息
    公共医学 
    启用整合素结合 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    实现铁离子结合 国际开发协会
    根据直接分析推断
    更多信息
    公共医学 
    启用mRNA结合 国际开发协会
    根据直接分析推断
    更多信息
    公共医学 
    启用mRNA结合 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    实现分子隔离活性 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    使核雄激素受体结合 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    启用核输出信号受体活性 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    使肽结合 国际开发协会
    根据直接分析推断
    更多信息
    公共医学 
    实现蛋白质结合 IPI公司
    从物理相互作用推断
    更多信息
    公共医学 
    使泛素蛋白连接酶结合 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    实现未折叠蛋白质结合 国际能源署
    从电子注释推断
    更多信息
     
    过程 证据代码 酒吧
    参与ERAD途径 国际律师协会
    从祖先的生物学角度推断
    更多信息
     
    参与心肌细胞分化 IEP公司
    从表达式模式推断
    更多信息
    公共医学 
    参与细胞对电刺激的反应 IEP公司
    从表达式模式推断
    更多信息
    公共医学 
    参与细胞对锂离子的反应 IEP公司
    从表达式模式推断
    更多信息
    公共医学 
    参与细胞对有机物的反应 IEP公司
    从表达式模式推断
    更多信息
    公共医学 
    参与细胞对病毒的反应 IEP公司
    从表达式模式推断
    更多信息
    公共医学 
    参与细胞衰老 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    皮层肌动蛋白细胞骨架组织内的上游肌动蛋白 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    参与DNA模板转录的负调控 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    参与细胞内类固醇激素受体信号通路的负调控 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    参与神经元分化的负调控 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    参与维甲酸受体信号通路的负调控 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    参与RNA聚合酶II对转录的负调控 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    翻译中的负调节 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    参与滋养层细胞迁移的负调控 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    MHCⅠ类蛋白复合物参与肽抗原组装 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    细胞周期正向调节的上游因子 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    参与细胞周期的正调控 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    参与细胞群体增殖的正调控 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    参与树突状细胞趋化性的正调控 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    参与内皮细胞迁移的正调控 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    参与基因表达的正调控 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    acts_upstream_of_or_within非规范NF-kappaB信号转导的正调控 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    参与吞噬作用的正调控 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    参与底物粘附依赖性细胞扩散的正调控 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    参与细胞核蛋白质输出 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    参与蛋白质折叠 国际律师协会
    从祖先的生物学角度推断
    更多信息
     
    参与蛋白质折叠 国际能源署
    从电子注释推断
    更多信息
     
    参与蛋白质折叠 TAS公司
    可追溯作者声明
    更多信息
    公共医学 
    参与蛋白质核定位 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    参与蛋白质稳定 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    参与蛋白质稳定 国际空间站
    根据序列或结构相似性推断
    更多信息
     
    acts上游of或在减数分裂核分裂的调控范围内 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    与雌二醇反应有关 IEP公司
    从表达式模式推断
    更多信息
    公共医学 
    参与糖苷反应 IEP公司
    从表达式模式推断
    更多信息
    公共医学 
    与有机物反应有关 IEP公司
    从表达式模式推断
    更多信息
    公共医学 
    参与睾酮反应 IEP公司
    从表达式模式推断
    更多信息
    公共医学 
    参与对外来刺激的反应 IEP公司
    从表达式模式推断
    更多信息
    公共医学 
    参与精子发生 IEP公司
    从表达式模式推断
    更多信息
    公共医学 
    组件 证据代码 酒吧
    MHC I类肽负载复合物的一部分 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    位于顶体小泡中 伊达
    根据直接分析推断
    更多信息
    公共医学 
    位于单元格表面 国际开发协会
    根据直接分析推断
    更多信息
    公共医学 
    位于单元格表面 国际能源署
    从电子注释推断
    更多信息
     
    含有胶原蛋白的细胞外基质 国际开发协会
    根据直接分析推断
    更多信息
    公共医学 
    定位于皮质颗粒 国际能源署
    从电子注释推断
    更多信息
     
    定位于皮质颗粒 国际空间站
    根据序列或结构相似性推断
    更多信息
     
    定位于细胞溶解颗粒 国际能源署
    从电子注释推断
    更多信息
     
    位于细胞质中 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    定位于胞浆中 国际能源署
    从电子注释推断
    更多信息
     
    定位于胞浆中 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    定位内质网 国际开发协会
    根据直接分析推断
    更多信息
    公共医学 
    定位内质网 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    定位内质网腔 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    内质网膜is_active 国际律师协会
    从祖先的生物学角度推断
    更多信息
     
    定位内质网质控室 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    位于质膜外侧 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    位于细胞外区域 国际能源署
    从电子注释推断
    更多信息
     
    位于细胞外空间 国际开发协会
    根据直接分析推断
    更多信息
    公共医学 
    位于细胞外空间 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    定位膜 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    位于核外壳内 国际开发协会
    根据直接分析推断
    更多信息
    公共医学 
    位于核膜内 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    位于核内 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    位于细胞质核周区 国际开发协会
    根据直接分析推断
    更多信息
    公共医学 
    位于细胞质核周区 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    蛋白质复合物的一部分 国际开发协会
    根据直接分析推断
    更多信息
    公共医学 
    定位于核糖体 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    肌浆网定位 国际开发协会
    根据直接分析推断
    更多信息
    公共医学 
    位于肌浆网腔内 国际能源署
    从电子注释推断
    更多信息
     
    定位于滑面内质网 国际开发协会
    根据直接分析推断
    更多信息
    公共医学 

    一般蛋白质信息

    首选名称
    钙网蛋白
    姓名
    驾驶室3
    CALBP公司
    CRP55型
    ERp60
    HACBP公司
    钙结合蛋白3
    钙调节蛋白
    内质网滞留蛋白60

    NCBI参考序列(RefSeq)

    新款 尝试新的成绩单表

    独立于注释的RefSeq维护基因组

    这些参考序列独立于基因组构建而存在。解释

    这些参考序列与基因组无关注释循环,因此其版本可能与当前的RefSeq版本不匹配基因组构建。通过比较中RefSeq的版本来确定版本不匹配本节至中报告的那一节基因组区域,成绩单和产品以上。

    mRNA和蛋白质

    1. NM_022399.2号NP_071794.1号钙网蛋白前体

      参见NP_071794.1的相同蛋白质及其注释位置

      状态:已验证

      源序列
      AW672583、BC062395、BU671467
      UniProtKB/瑞士Prot
      第10452页,第18418页
      UniProtKB/TrEMBL公司
      A0A8L2Q1G7型,A6IY70型
      相关的
      ENSRNOP00000080548.1公司,ENSRNOT00000113427.1号文件
      保守领域(1)总结
      pfam00262型
      位置:23332
      钙网蛋白;钙网蛋白家族

    注释基因组参考序列:GCF_036323735.1-RS_2024_02

    以下部分包含属于特定基因组构建。解释

    参考GRCr8

    基因组学

    1. NC_086037.1参考GRCr8

      范围
      40213367..40218262
      下载
      GenBank(基因银行),美国金融服务贸易协会,序列查看器(图形)