国家生物技术信息中心的成立(美国国立生物技术信息中心)1988年11月,主要是通过三项独立但相关的行动的合并而发生的。他们是:
1984年,基础生物医学研究代表团开始在希尔举行简报会,邀请詹姆斯·沃森博士和大卫·巴尔的摩博士等诺贝尔奖获得者向立法者介绍基因组研究作为科学研究进步的新组成部分的重要性。这些简报会被认为是在国会营造一种氛围的关键,这种氛围可以接受建立一个生物技术信息中心,就像美国国立生物技术信息中心.
同样在1984年,Donald A.B.Lindberg博士成为国家土地管理局之后不久,领导国家图书馆进行了重大的长期规划工作。生物医学界100多名领导人参与了这一严格的过程,形成了5个小组,涵盖NLM的主要领域。特别值得注意的是题为“从数据库中获取事实信息”的小组3——这将证明是美国国立生物技术信息中心最初构思。
中心概念的萌芽在很大程度上源于哈佛大学生物化学教授Allan Maxam博士,他是分子遗传学的先驱,并在1986年担任核心成员国家土地管理局长期规划小组。他向第三小组的其他成员说明了他们应该赋予生物技术领域的重要性,并告知他们国家需要利用即将到来的科学遗传革命产生的大量数据。规划小组和NLM董事会,接受了这样一种想法,即需要一个既可以作为不断增长的基因组和遗传知识的存储库和分发中心,又可以作为开发新的计算机分析和通信工具以管理分子生物学信息的独特资源的组织。
新成立的国家土地管理局他认为这是一个向国会提出生物技术信息中心需求的好时机,并找到了医学研究的主要倡导者、参议员克劳德·佩珀(Claude Pepper)。佩珀参议员意识到他的国会同僚需要接受有关生物技术研究益处的教育,因此要求NLM制定一份文件,用于解释建立中心的必要性。由此产生的文件被称为“谈论一种遗传语言:建立国家生物技术信息中心的必要性”,它构成了引入最初法案(H.R.5271)的背景,以创建美国国立生物技术信息中心作为NLM的一部分。该法案是在国会会议后期提出的,没有采取任何行动,但在下一次会议上,一位坚定的参议员佩珀再次提出了该法案。
1987年3月6日,身为众议院老龄问题委员会主席的佩珀参议员提出了他的新法案(H.R.393)美国国立生物技术信息中心他表示,该中心将“处理人类生命的奥秘和展开的知识卷轴,寻求穿透生命本身的奥秘”。听证会有15名引人注目的证人,包括联邦和学术卫生高级官员以及五名受益于生物技术的患者。
尽管该法案遇到了一些立法障碍,但佩珀参议员通过获得385万美元的拨款,继续努力,以在国家土地管理局在这段时间内,利斯特希尔生物医学通信中心主任丹尼尔·马斯斯博士及其分会主任丹尼斯·本森博士发起了NLM早期的生物技术信息活动。
次年,佩珀参议员在众议员亨利·瓦克斯曼(Henry Waxman)、参议员爱德华·肯尼迪(Edward Kennedy)和劳顿·奇尔斯(Lawton Chiles)的帮助下,将H.R.393纳入了美国国立卫生研究院(NIH)的重新授权法案,即《健康综合推广法案P.L.100-607》。1988年11月4日,该法案在国会获得通过,并由里根总统签署成为法律。
法案颁布后,佩珀参议员在国会大厦迈克·曼斯菲尔德会议室举行的仪式上谈到生物技术和新中心:“我希望并祈祷它能够通过延长生命、促进人类健康和幸福,实现我们许多人长期以来珍视的梦想。”
该法案规定了新成立的国家生物技术信息中心的以下职能:
- 1
设计、开发、实施和管理自动化系统,用于收集、存储、检索、分析和传播有关人类分子生物学、生物化学和遗传学的知识;
- 2
研究先进的基于计算机的信息处理方法,能够表示和分析大量重要的生物分子和化合物;
- 三。
使从事生物技术研究和医疗的人员能够使用根据第款开发的系统(
1
)以及第(2)款所述的方法
; 和
- 4
尽可能协调在国际基础上收集生物技术信息的工作。
从800万美元的适度预算和十几名工作人员开始,美国国立生物技术信息中心开始了成为国家分子生物学信息资源的历程。David Lipman博士是美国金融服务贸易协会算法,从NIDDK招募,并被任命为NCBI主管。在他的三位主要任命者的支持下。Dennis Benson,信息资源处处长;David Landsman博士,计算生物学分部主任;和James Ostell博士,信息工程部主任。利普曼迅速将该中心发展成为分子生物学革命中的主要信息中心。
美国国立生物技术信息中心现在是公共生物医学数据库、用于分析分子和基因组数据的软件工具以及计算生物学今天,NCBI为医学和科学界以及公众创建并维护了40多个综合数据库。其网站每天有超过300万的访问者,每天下载的数据约为27 TB,用户数量和下载量每年都急剧增加。
下面列出了过去25年中发生的许多重大里程碑:
1990—爆炸-介绍了基本局部对齐搜索工具(BLAST);优化了速度,序列比较算法可以快速找到与自己相似的序列查询. 1993—网络Entrez公司-Network Entrez,客户端-服务器版本的光盘-ROM被引入,将Entrez引入互联网。 1995—基因组-这个新资源组织基因组信息,包括序列、地图、染色体、组装和注释。
1995—Bankit银行-引入在线工具是为了方便提交给GenBank。
1997—公共医学—美国国立生物技术信息中心将PubMed引入整个MEDLINE,这是一个可自由访问的书目检索系统数据库这项新服务是由副总统阿尔·戈尔(Al Gore)和劳工/卫生与公众服务部拨款小组委员会高级成员、参议员汤姆·哈金(D-IA)和参议员阿伦·斯佩克特(R-PA)在国会山的一次活动上推出的,突出了其重要性。 1998—美国国立卫生研究院新的基于疾病的服务-与NIH疾病服务研究所建立合作关系,如CGAP公司癌症基因组解剖项目,以确定在不同癌症状态下表达的人类基因。
1999—人类基因组-人类基因组计划研究人员对第一个人类进行了完整测序染色体(#22)并将序列数据存放在美国国立生物技术信息中心.整个人类的工作草案基因组第二年完成,可从NCBI免费访问。 1999—基因组资源套件—美国国立生物技术信息中心发布大量资源以支持对人员的全面分析基因组包括:本地链接-遗传位点的关键描述符;参考序列-非冗余人类参考序列集;和数据库SNP-人类遗传变异数据的收集。 2000—公共医学中心—美国国立生物技术信息中心首次公开其生物医学和生命科学期刊文献的免费全文数字档案。PubMed Central(PMC)是国家土地管理局其广泛的印刷期刊收藏,符合国家图书馆收集和保存世界生物医学文献的立法授权。 2000—地理-基因表达总览数据库是为了响应社区对高吞吐量生成的数据的公共存储库的兴趣而启动的微阵列实验。 2002—工作组-GenBank开始包括由半自动技术生成的全基因组鸟枪序列。 2003—Entrez公司基因-Entrez基因数据库(以前称为LocusLink)是为了提供地图、序列、表达式配置文件、结构、功能、,同源性数据和科学文献。 2004—公共化学-PubChem公司数据库发布,提供关于小分子的化学结构和生物活性的信息。 2005—NIH公共访问-NIH制定了一项公共获取政策,通过以下方式向科学家、研究人员和公众提供NIH资助研究的公开结果美国国立生物技术信息中心的PubMed Central。NCBI开发了NIH手稿提交系统,允许研究人员向PubMed Central提交他们发表的论文。 2005—性化服务-NCBI引入了My NCBI工具,它保留了用户信息和数据库为许多NCBI数据库提供定制服务的首选项。 2006—数据库间隙P—美国国立生物技术信息中心启动数据库基因型和表型(dbGaP),以存档和分发研究基因型和表型相互作用的研究结果。研究包括全基因组关联研究(GWAS)、医学测序和分子诊断分析等。 2007—基因组参考联盟-联合体美国国立生物技术信息中心创建了EBI、桑格研究所和基因组研究所,以提高人类参考物的序列质量和准确性基因组它的任务是改进其他模式生物的参考序列,包括老鼠和斑马鱼,它们经常被用作人类疾病的模型。 2008—发现计划—美国国立生物技术信息中心启动一项计划,帮助用户更好地探索NCBI资源中包含的大量数据。使用自动化方法显示用户在原始搜索中可能看不到的相关数据查询但这可能会带来意外发现。 2008—公共访问成为强制性-国会通过立法,要求科学家向PubMed Central提交由NIH资助产生的最终同行评审期刊手稿。该政策要求这些论文在发表后12个月内在PubMed Central上公开。
2008—1000基因组项目—美国国立生物技术信息中心对这个国际公私联合会的数据进行归档和分发,该联合会旨在建立最详细的人类基因变异地图。在2012NCBI通过合作,通过Amazon Web Services在云端提供这些数据,从而提高了这些数据的可访问性。 2010—我的书目—美国国立生物技术信息中心介绍了My Bibliography工具,以简化收集已发表文章和其他材料的过程。该工具与NIH的拨款管理系统相连,还帮助研究人员遵守NIH公共获取政策。 2011—PubMed健康-该服务旨在为消费者和临床医生提供有关疾病和条件预防和治疗的信息,重点是临床疗效研究的回顾。2018年10月31日停产,因此国家土地管理局可以整合其消费者健康信息和比较有效性资源,使其更容易在PubMed、MedlinePlus和Bookshelf中找到。 2012—遗传检测注册中心(GTR)—美国国立生物技术信息中心与NIH合作,推出了GTR,以满足医疗保健提供者、研究人员、患者和其他人对基因检测信息的需求。这个数据库提供有关基因测试的可用性、有效性和有用性的信息。 2013—ClinVar公司—美国国立生物技术信息中心创建ClinVar数据库收集序列变异及其与人类健康关系的信息。该数据库包括来自外部研究和测试小组的提交文件,以及来自dbSNP、dbVar、dbGap和Gene Reviews等来源的内部数据。 2013—PubReader(公共阅读器)—美国国立生物技术信息中心开发一种新的演示风格,通过台式机、笔记本电脑或平板电脑上的浏览器优化PMC文章的阅读。
对美国国立生物技术信息中心和国家土地管理局可以在2007年医学图书馆协会年会上发表的Joseph Lieter NLM/MLA演讲中找到(1).
工具书类
- 1
史密斯KA。现代国家医学图书馆的法律、领导人和传奇。医学图书馆协会杂志。2008年4月;96(2):121–33.[PMC免费文章:PMC2268223] [公共医学: 18379667]