总结
NIH手稿提交系统(NIHMS公司)处理向PubMed Central(PMC)提交全文手稿材料的事宜,以支持NIH Public Access和其他相关的资助机构对非PMC参与期刊上发布的材料的政策。NIHMS系统允许用户,如作者、主要调查人员(PI)和出版商提供转换为XML格式PMC可以接受的格式的文档。文件在转换过程中经历了多个阶段;初始提交、拨款报告、初始转换批准、员工质量保证,转换,转换材料的质量保证,网络版本批准和引文匹配。
历史
NIHMS公司创建于2005年,是NIH公共访问政策该政策要求将NIH资助的研究存放在PubMed Central。对于那些文章发表在没有直接向PMC提交内容的期刊上的作者,需要一种提交方法。NIHMS的创建是为了允许用户存放手稿源文件,以便转换为PMC文章。
该政策最初是自愿的,于2005年5月生效。在接下来的几个月里,合规性仍然很低。该政策随后于2008年4月成为强制性政策。
摄入
NIHMS公司从各种提交者接收源文件。大多数投稿都是通过Web界面以单个稿件的形式输入的。任何在系统中拥有帐户的人都可以开始提交,但必须得到论文作者的批准,并且必须报告适当的资金以备记录。
高比例的手稿NIHMS公司由出版商启动,作为对其作者的服务。
摄入QA
一旦材料提交给NIHMS公司,它必须经过质量保证由工作人员进行审查,确保材料完整,适合转换,在NIH公共访问政策范围内,并且不代表重复提交。工作人员还检查资金,以确保报告的资金是适用的,并且提交文件的批准方是论文的作者。
通过员工的提交质量保证评估将在处理转换时发送。未通过QA的项目可能会被阻止进行进一步处理,与现有记录合并,或返回给提交者或作者进行更正。
在此阶段对提交的材料进行额外的自动检查,以确保材料与国家土地管理局并且不属于任何PMC参与期刊的PMC参与期。持有相关资金但未参与提交过程的个人投资者此时会收到与其拨款相关的材料存放通知。
转换
一旦满足这些要求,手稿将被发送给文档转换供应商,以转换为XML格式.
转换供应商返回NIHMS公司全文XML格式手稿文件,缩略图、Web和PDF格式演示文稿,以及最初可能作为嵌入在原始源文件中的内容提供的任何提取的补充文件。
NIHMS中的XML
无论源文档格式如何,所有提交的手稿都会转换为全文XML格式使用国家土地管理局 JATS公司(期刊文章标记套件)期刊发布模型。
这个XML格式文档被视为已转换的文档。网络和PDF格式从XML呈现的显示是文档的显示版本,但更改和更正是在基本XML或呈现软件上执行的,而不是直接在Web或PDF版本上执行。
无法用普通语言捕获的复杂数学内容JATS公司使用捕获标记和显示公式数学ML.
在自己的窗口中查看
源文件 |
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渲染的表达式 |
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XML在通信中的应用
XML格式也用于系统之间的大部分通信和数据切换。来自通过提交的发布者的传入交付FTP文件交付包括XML格式的元数据文档,其中包含启动系统中的手稿记录所需的文章信息。
发送给转换供应商的包包括元数据文档,其中包含必须包含在标记的手稿中的系统特定信息。
转化材料质量保证
转换后的材料NIHMS公司经历了几次质量保证在发送给PMC之前,由各个组执行步骤。
第一个质量保证步骤包括对有效性和符合性的自动检查NIHMS公司文件标准。此级别的故障将直接返回给转换供应商。当交付通过这些检查时,系统生成HTML和PDF格式手稿的版本。
一旦生成了这些显示版本,手稿就会发送给外部质量保证确认转换或渲染过程中没有引入错误的团队。未通过此外部评估的手稿将被定向到NIHMS公司工作人员进行进一步调查。通过此评估的手稿将发送给作者,供其审查和批准转换后的材料。
手稿的指定审查作者审查展示版本(HMTL和PDF格式)并且可以按原样接受原稿,也可以通过评论拒绝原稿。作者不仅可以报告转换或渲染中的错误,还可以请求对材料进行任何必要的更新,以确保科学准确性。
外部拒绝的材料质量保证或作者由NIHMS公司员工。工作人员可以将材料退还给转换供应商进行更新,向提交者或作者请求其他文件,进行手动更新,或请求NIHMS系统中的渲染更新。
其他处理
在作者批准后,向PubMed Central交付和随后分配PubMed-Central ID号(PMCID)不是自动的NIHMS公司Web版本。记录还必须与PubMed引文相匹配,以确认发布并计算PMC中的发布日期。对于从PMID(项目管理标识)由作者进行匹配,或存放来自发布者的可信发布信息,这些信息可用于执行自动匹配。对于未通过这些方法匹配的记录,工作人员必须根据系统建议的匹配、手动PubMed搜索或作者在提交手稿时单独提供的匹配进行匹配。
对于MEDLINE中未编入索引的期刊记录,必须为NIHMS公司记录。这包括国家医学图书馆团队成员审查手稿记录,将材料与各种外部引文索引网站或出版商网站上的信息进行匹配,以确认出版信息。在极少数情况下,对于MEDLINE中未编入索引的期刊,如果没有可公开访问的在线存在,我们可能会要求作者提供存档文件,以验证引文。
一旦作者批准了网络版本并将其与引文记录相匹配,则可以将该记录发送给PubMed Central。然后PMC执行额外的自动化质量保证检查提交内容。如果手稿通过这些检查,将生成PMCID并分配给记录。如果记录未通过这些检查,则返回给NIHMS公司评估人员。定期进行PMC完整性检查后,记录也可能会返回给NIHMS员工。
PMC中的记录将保持“隐藏”状态,直到记录的最终发布日期,再加上提交人或作者指定的任何额外禁运期。
报告系统和NIHMS
在大多数情况下,在NIHMS公司将生成PMCID,证明完全符合NIH公共访问政策,尽管NIHMS中的一些记录仅用于报告拨款与特定文件的关联。NIHMS ID是记录拨款和条款之间关系以及这些条款合规状态的重要方面。
NIH公共访问政策要求将非PMC期刊的记录提交给NIHMS公司稿件验收时;要求中没有宽限期。适用论文缺乏NIHMS ID将导致作者被报告为不合规。NIH资助方可在文章印刷出版日期后90天内使用NIHMS ID作为遵守公共访问政策的证据,之后必须使用PMCID。NIHMS ID不是符合性的永久证据。
然而,NIHMS公司不直接报告合规性。该系统为各种资源提供拨款和纸张关联,并在分配时提供NIHMS ID和PMCID的状态信息。从这些资源合规性监控系统(如向机构提供合规性报告的PACM和为个人提供合规报告的eRA Commons)可以计算与NIH公共访问策略相关的物品合规性状态。