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Xenopus_laevis_v2

生物体名称:
非洲爪蟾
具体名称:
菌株:J
性别:
女性的
生物样品:
SAMN04518361号
生物项目:
PRJNA313213型
提交人:
国际爪蟾测序协会
日期:
2016/08/09
同义词:
xenLae2公司
装配级别:
染色体
基因组表示:
满的
从RefSeq中排除:
  • 被更新的物种集合所取代
GenBank组件加入:
GCA_001663975.1(最新)
RefSeq程序集加入:
GCF_001663975.1(抑制)参见该物种的最新RefSeq组件
RefSeq组件和GenBank组件相同:
没有(隐藏详细信息)
  • 仅在RefSeq:染色体MT中
  • 为GenBank版本显示的数据
WGS项目:
LYTH01公司
装配方法:
Meraculous诉2013年5月
基因组覆盖率:
30倍
测序技术:
Illumina HiSeq 2000公司

标识:779791【UID】3378498[基因银行]3380878[参考序列]

请参见基因组的信息非洲爪蟾

这个有机体有两个组件

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历史(显示修订历史)

注释

全球统计

序列总长度2,718,416,252
总未映射长度2,408,707,234
脚手架之间的间隙0
脚手架数量108,032
脚手架N50136,570,856
脚手架L509
连续数324,060
康蒂格N502013年
轮廓L5036,507
染色体和质粒总数18
组件序列数(WGS或克隆)324,060

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全局程序集定义

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装配单元名称
主要组件
装配单元:初级装配(GCA_001663985.1)
分子名称GenBank序列RefSeq序列未本地化
序列计数
染色体1LCM004466.1号=新冠_030724.10
染色体1SCM004467.1号=NC_030725.1号0
染色体2LCM004468.1号=NC_030726.1号0
染色体2SCM004469.1号=NC_030727.1号0
染色体3LCM004470.1型=NC_030728.1号0
染色体3SCM004471.1号=新冠肺炎30729.10
染色体4LCM004472.1号=NC_030730.1号0
染色体4SCM004473.1号=NC_030731.1号0
染色体5LCM004474.1号=NC_030732.1号0
染色体5SCM004475.1型=NC_030733.1号0
染色体6LCM004476.1号=新冠_030734.10
染色体6SCM004477.1号=NC_030735.1号0
染色体7LCM004478.1号=NC_030736.1号0
染色体7S厘米004479.1=NC_030737.1号0
染色体8LCM004480.1型=NC_030738.1号0
染色体8SCM004481.1号=NC_030739.1号0
染色体9_10LCM004482.1号=NC_030740.1号0
染色体9_10SCM004483.1号=NC_030741.1号0
未放置的不适用不适用不适用108014个

程序集统计

分子总计
长度
脚手架
计数
无间隙
长度
脚手架
50新元
跨越(Spanned)
差距
未平移
差距
全部2,718,416,252108,0322,408,707,234136,570,856216,0280
染色体1L219,802,4681196,756,408219,802,46816,1040
染色体1S179,946,9651159,667,175179,946,96513,2880
染色体2L181,146,8891160,767,560181146889年14,5060
染色体2S159,726,4901141,916,988159,726,49011650人0
染色体3L144,167,3701128,843,420144,167,37010,9670
染色体3S120,483,1131107,277,385120483113个8,9050
染色体4L144,084,6801129,516,523144,084,68010,8480
染色体4S121,245,9771108,533,205121,245,9778,7560
染色体5L159,361,9911141,481,405159,361,99113276人0
染色体5S136,570,8561120,151,392136,570,85610,2280
染色体6L155,008,7531138137170个155,008,75311,7690
染色体6S128,359,5861113,327,136128,359,58610,0090
染色体7L126,821,0451112,470,531126,821,04510,0570
染色体7S89,646,5441邮编:7898601889,646,5447,4460
染色体8L120,101,3781107,068,295120,101,3789,4130
染色体8S98,932,710185,823,43398,932,7108,4910
染色体9_10L117,834,3701106615028117,834,3709,0430
染色体9_10S104,563,341194,275,475104,563,3417,9210
未放置210,611,726108,014177,092,6871,160,37823,3510