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标识:1668981【UID】6347868[基因银行]6367748[参考序号]
目前的红原鸡(Gallus Gallus)基因组组合GRCg6a是用单分子实时(SMRT)测序技术测序和组装的,测序深度约为80倍。同一个DNA参考源,一个名为“RJF#256”的女性...在Pacific Biosciences RSII仪器上对一个近交系(UCD 001)进行测序(P6和P5化学读数的相对等分),所有读数都用FALCON汇编程序进行组装。为了认识到需要改进染色体的组装邻接性和表达,我们生成了一个高染色质接近图,以帮助组装序列的顺序和方向。改进后的染色体序列的创建过程与Gallus_Gallus-5.0版本的创建过程类似。为了避免在从Gallus_Gallus-5.0到GRCg6a的转换过程中丢失序列,将在前一组中发现的完成的RJF BAC克隆并入最终染色体序列中,在适当的情况下替换潜在的WGS连接。有关详细信息,请参阅:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/grc/chicken。美国农业部、美国国家人类基因组研究所(NHGRI)、美国国家卫生研究院(NIH)和科布·范特斯(Cobb Vantresh)为鸡基因组序列表征提供了资金。GRCg6a与早期GRCg6版本的不同之处在于消除了四个冗余的未缩放脚手架。 更多
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