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美国国立生物技术信息中心
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新建搜索
7VVZ型
:
NuA4与核小体结合
生物单元1:
21元
源生物:
酿酒酵母S288C,
▼
分类学
关闭
分类学
分子
酿酒酵母S288C
Y、 V、T、P、E、F、G、K、H
非洲爪蟾
O、 Q、S、U、A、B、N、D
酿酒酵母
W、 I、X、L
蛋白质数量:
肌动蛋白,肌动蛋白相关蛋白4,染色质修饰。。。
▼
)
蛋白质分子
关闭
Y(Y)
Y-点击探索这个分子邻居
染色质修饰相关蛋白EAF6
V(V)
V-点击探索这个分子邻居
染色质修饰相关蛋白YNG2
T型
点击探索这个分子邻居
H(H)
H-点击探索这个分子邻居
多梳样蛋白增强剂1
O(运行)
O-点击探索这个分子邻居
A类
A-点击浏览此分子邻居
组蛋白H3
问
Q-点击探索这个分子邻居
B类
B-单击以探索此分子邻居
组蛋白H4
S公司
S-点击探索这个分子邻居
N个
N-点击探索这个分子邻居
组蛋白H2A
单位
点击U键探索这个分子邻居
D类
D-点击探索这个分子邻居
组蛋白H2B 1.1
P(P)
点击探索这个分子邻居
组蛋白乙酰转移酶ESA1
X(X)
X-点击探索这个分子邻居
Epl1精氨酸锚定
E类
E-点击探索这个分子邻居
染色质修饰相关蛋白EAF1
F类
F-点击探索这个分子邻居
肌动蛋白相关蛋白4
G公司
G-点击探索这个分子邻居
肌动蛋白
K(K)
K-点击探索这个分子邻居
SWR1复合蛋白4
L(左)
L-单击以探索此分子邻居
转录相关蛋白1
核苷酸数量:
2(DNA(207-mer)
▼
)
核苷酸分子
关闭
W公司
W-点击探索这个分子邻居
DNA(207-mer)
我
I-点击探索这个分子邻居
DNA(207-mer)
化学品数量:
5(腺苷-5’-三磷酸(2),羧甲基中心。。。
▼
)
化学品
关闭
腺苷-5’-三磷酸(2)
羧甲基辅酶*A
镁离子(2)
类似结构(28)
原始VAST
下载VAST+
▼
显示筛选器
按匹配分子数过滤
部分
部分匹配,8
–
部分
部分匹配,1个蛋白质(
23
)
–
按分类筛选
真核生物(26)
–
其他(2)
–
应用筛选器选择
显示
1
到
10
第个,共个
28
选定的结构
在结果中搜索:
去吧
重置
PDB ID
描述
分类学
▲
▼
对齐蛋白质
▲
▼
风险管理与可持续发展部
▲
▼
对齐残留物
▲
▼
序列标识
▲
▼
1
展开行
部分
7辆
与M3814复合物中的DNA-PKcs
智人
1
6.21Å
2002
12%
2
展开行
部分
7OTV电视
DNA-PKcs与沃特曼蛋白复合物
智人
1
5.94Å
1871
12%
3
展开行
部分
7EG6型
与核小体结合的Snf5指螺旋
其他
8
0.29Å
734
99%
4
展开行
部分
4Z66型
核小体二联轴附近的H3乙酰化增强了RSC和SWI/SNF对核小体的分解
非洲爪蟾/智人
8
0.60Å
728
99%
5
展开行
部分
4YS3型
核小体二联轴附近的H3乙酰化增强了RSC和SWI/SNF对核小体的分解
非洲爪蟾/智人
8
0.55Å
725
99%
6
展开行
部分
7SCZ公司
Nuc147绑定到多个BRCT
智人
8
0.56Å
725
98%
7
展开行
部分
7VDT(视频显示终端)
人染色质重塑PBAF-核小体复合体的运动核小体模块
其他
8
0.43Å
724
100%
8
展开行
部分
7RSJ公司
VPS34激酶结构域与化合物14的结构
智人
1
4.89Å
424
12%
9
展开行
部分
7RSV阀
VPS34激酶结构域与化合物5的结构
智人
1
3.95Å
383
13%
10
展开行
部分
7RSP公司
VPS34激酶结构域与化合物14的结构
智人
1
4.25Å
366
12%
显示
结构
弗斯特
上一个
第页
属于
3
页码
下一步
最后
正在更新。。。
{“1”:“染色质修饰相关蛋白EAF6”,“2”:“染色体修饰相关蛋白YNG2”,“3”:“多梳类蛋白增强剂1”,“4”:“组蛋白H3”,“5”:“组蛋白H4”,“6”:“H2A组蛋白”,“7”:“H2B 1.1”,“8”:“H组蛋白”转移酶ESA1“,”15“
:“Epl1精氨酸锚定”,“16”:“染色质修饰相关蛋白EAF1”,“17”:“肌动蛋白相关蛋白4”,“18”:“Actin”,“19”:“SWR1-复合蛋白4”
引用VAST
Gibrat JF、Madej T、Bryant SH。
”
结构比较惊人的相似性。
",
Curr Opin Struct Biol.1996年6月;
6(3):377-85
Madej T、Lanczycki CJ、Zhang D、Thiessen PA、Geer RC、Marchler-Bauer A、Bryant SH。
”
MMDB和VAST+:追踪大分子复合物之间的结构相似性。
”
编号。
《酸性研究》,2014年1月;
42(数据库问题):D297-303
托马斯·马德伊、阿伦·马切勒·鲍尔、克里斯托弗·兰茨基、张达川、斯蒂芬·布莱恩特
”
生物组装与VAST的比较
”
方法分子生物学。
2020(2112):175-186
X(X)
?
原始VAST
原始VAST在查询结构中查找与单个蛋白质分子或单个3D域相似的结构。
从下表中选择感兴趣的蛋白质分子(“链”)或3D域,以查看具有类似3D形状的其他蛋白质或域的列表。
与侧重于默认生物单元的VAST+相反,Original VAST列出了查询结构的非对称单元中的所有蛋白质分子。