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美国国立生物技术信息中心
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生物技术信息
新建搜索
500万
:
含She2p和ASH1 mRNA E3-localization元件的核复合物的晶体结构
生物单元1:
非聚物
源生物:
酿酒酵母S288C,
▼
分类学
关闭
分类学
分子
酿酒酵母S288C
H、 J、I
酿酒酵母RM11-1a
D、 C、B、A
酿酒酵母
E、 F类
蛋白质数量:
7(SWI5-依赖性HO表达蛋白2,SWI5-de。。。
▼
)
蛋白质分子
关闭
D类
D-点击探索这个分子邻居
C类
C-点击探索这个分子邻居
B类
B-点击探索这个分子邻居
A类
A-点击浏览此分子邻居
SWI5依赖性HO表达蛋白2
H(H)
H-单击以探索此分子邻居
J型
J-点击探索这个分子邻居
我
I-点击探索这个分子邻居
SWI5依赖性HO表达蛋白3
核苷酸数量:
2(ASH1-E3元素,RNA(28-MER)
▼
)
核苷酸分子
关闭
E类
E-点击浏览这个分子邻居
如果
F-点击探索这个分子邻居
ASH1-E3元件,RNA(28-MER)
化学品数量:
23(乙酸离子(6)、1,2-乙二醇(11)、镁。。。
▼
)
化学品
关闭
醋酸离子(6)
1,2-乙二醇(11)
镁离子(6)
类似结构(81)
原始VAST
下载VAST+
▼
显示筛选器
按匹配分子数过滤
部分
部分匹配,4
–
部分
部分匹配,2个蛋白质(
1
)
–
部分
部分匹配,1个蛋白质(
79
)
–
按分类筛选
真核生物(8)
–
细菌
(61)
–
其他(12)
–
应用筛选器选择
显示
1
到
10
由于
81
选定的结构
在结果中搜索:
去
重置
PDB ID
描述
分类学
▲
▼
对齐蛋白质
▲
▼
风险管理与可持续发展部
▲
▼
对齐残留物
▲
▼
序列标识
▲
▼
1
展开行
部分
500万焦
含有She2p、She3p和ASH1 mRNA E3-校准元件的细胞质复合体的晶体结构
酿酒酵母/酿酒酵母RM11-1a
4
0.66Å
925
100%
2
展开行
部分
1XLY(1XLY)
RNA-结合蛋白SHE2p的X射线结构
酿酒酵母
2
0.95Å
405
100%
三
展开行
部分
4万千瓦
RNA-结合蛋白复合物的X射线结构
酿酒酵母AWRI1631/酿酒酵母S288C
1
0.61Å
218
99%
4
展开行
部分
3MAC公司
GP41衍生蛋白与fab 8062配合物的晶体结构
其他
1
4.21Å
175
7%
5
展开行
部分
三氧化二铁
基于HIV gp41的单链5螺旋束gp41-5的晶体结构
其他
1
4.63Å
175
7%
6
展开行
部分
3MA9公司
gp41衍生蛋白与fab 8066复合物的晶体结构
其他
1
4.35Å
171
7%
7
展开行
部分
三氧化二磷
基于与gp41-5结合的gp41 CHR结构域的α/β肽复合物
其他
1
4.12Å
169
7%
8
展开行
部分
三氧化二铁
基于与gp41-5结合的gp41 CHR结构域的α/β肽复合物
其他
1
4.16Å
167
7%
9
展开行
部分
40万英镑
基于与gp41-5结合的gp41 CHR结构域的嵌合α/β肽复合物
其他
1
4.16Å
166
7%
10
展开行
部分
4DZU型
与gp41-5结合的3-α络合物
其他
1
4.17Å
166
7%
显示
结构
弗斯特
上一个
第页
属于
9
页
下一步
最后
正在更新。。。
{“1”:“SWI5依赖性HO表达蛋白2”,“2”:“SWI5依赖性HO表达蛋白2”,“3”:“SWI5依赖性HO表达蛋白2”,“4”:“SWI5依赖性HO表达蛋白2”,“7”:“SWI5依赖性HO表达蛋白3”,“8”:“SWI5依赖性HO表达蛋白3”,“9”:“SWI5依赖性HO表达蛋白3”}
引用VAST
Gibrat JF、Madej T、Bryant SH。
"
结构比较惊人的相似性。
",
Curr Opin Struct Biol.1996年6月;
6(3):377-85
Madej T、Lanczycki CJ、Zhang D、Thiessen PA、Geer RC、Marchler-Bauer A、Bryant SH。
"
MMDB和VAST+:追踪大分子复合物之间的结构相似性。
"
无。
《酸性研究》,2014年1月;
42(数据库问题):D297-303
托马斯·马德伊、阿伦·马切勒·鲍尔、克里斯托弗·兰茨基、张达川、斯蒂芬·布莱恩特
"
生物组装与VAST的比较
"
方法分子生物学。
2020年(2112年):175-186
X(X)
?
原始VAST
原始VAST在查询结构中查找与单个蛋白质分子或单个3D域相似的结构。
从下表中选择感兴趣的蛋白质分子(“链”)或3D域,以查看具有类似3D形状的其他蛋白质或域的列表。
与专注于默认生物单元的VAST+不同,Original VAST在查询结构的不对称单元中列出了所有蛋白质分子。