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胶质纤维酸性蛋白亚型X3[智人]

蛋白质分类

中间丝族蛋白(域体系结构ID 12057329)

中间丝族蛋白类似于结蛋白,结蛋白是一种肌肉特异性III型中间丝,对肌肉的正常结构和功能至关重要

图形摘要

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姓名 加入 描述 间隔 E值
长丝 pfam00038型
中间丝蛋白;
68-444 4.60e-121页

中间丝蛋白;


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灯丝_头 pfam04732型
中间丝头(DNA结合)区;这个系列代表N端子头。。。
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中间丝头(DNA结合)区;该家族代表中间丝的N-末端头部区域。中间丝头结合DNA。波形蛋白头部能够改变核结构和染色质分布,HIV-1蛋白酶释放的头部释放可能在HIV-1相关的细胞病变和致癌中发挥重要作用。头部区域的磷酸化会影响灯丝的稳定性。头部已经被证明与同一蛋白质的杆状结构域相互作用。


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灯丝_头 辉瑞04732
中间丝头(DNA结合)区;这个系列代表N端子头。。。
4-66 6.32e-08日

中间丝头(DNA结合)区;该家族代表中间丝的N末端头部区域。中间丝头结合DNA。波形蛋白头部能够改变核结构和染色质分布,HIV-1蛋白酶释放的头部释放可能在HIV-1相关的细胞病变和致癌中发挥重要作用。头部区域的磷酸化会影响灯丝的稳定性。头部与同一蛋白质的杆状结构域相互作用。


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Smc公司 COG1196号文件
染色体分离ATP酶Smc[细胞周期控制,细胞分裂,染色体分割]。。。
242-439年 4.87e-06

染色体分离ATP酶Smc[细胞周期控制,细胞分裂,染色体分割];


Pssm-ID:440809[多域]Cd长度:983  比特分数:49.16  E值:4.87e-06
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抄送:COG1196   437E类电子电气设备欧洲经济区eeaaeeeeeeeeallel航空公司每个 477
SMC_行程_B 钨极氩弧焊02168
染色体分离蛋白SMC,常见细菌型;SMC(…的结构维护。。。
244-495 1.18e-05

染色体分离蛋白SMC,常见细菌型;SMC(染色体结构维持)蛋白结合DNA,组织和分离染色体以进行分割。SMC蛋白存在于细菌、古菌和真核生物中。该家族代表大多数细菌的SMC蛋白。SMC基因通常与scpB(TIGR00281)和scpA基因相关,其中scp代表分离和浓缩蛋白。SMC在S期早期被诱导,但在整个细胞周期中存在并与DNA结合。【细胞过程、细胞分裂、DNA代谢、染色体相关蛋白】


Pssm-ID:274008[多域]Cd长度:1179  比特分数:48.13E值:1.18e-05
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吉1370470620 480TVEM公司DGEVIKESKQE公司 495
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46 PHA02562型
核酸内切酶亚基;临时的
231-416 5.09e-03年5月

核酸内切酶亚基;临时的


Pssm ID:222878[多域]Cd长度:562  比特分数:39.23  E值:5.09e-03年5月
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抄送:PHA02562  197IKT公司Y(Y)NKNIEEQRKKNGENI公司应收账K(K)--质量nK(K)YDE公司V(V)电气工程师A类----K(K)TIKA公司E类工业工程EL公司TDE公司------N个VMDIE公司D类PS(聚苯乙烯)AAL公司NKLN公司T型AA公司 264
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编号:PHA02562  341E类KNKISTNKQSLIT公司VDKAKKVK公司美国航空工业协会E类ELQA公司E类FVDNA公司E类E类洛杉矶K(K)QD公司E类LDKIVKTKSELVK公司E类 401
 
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吉1370470620 304K(K)EIR公司T型QYE公司调幅A类不锈钢N个MH公司是的SK公司时尚技术总监AAARN公司美国运通左后阿拉斯加州H(H)E类安迪右后QL公司质量保证体系中药E类SL公司RGTNE公司SLERQ公司先生E类电气工程师 383
抄送:pfam00038 173A类EIR公司A类QYE公司工程安装A类阿拉斯加州N个重新EAEEWY公司SK公司QQAAARN公司GDA公司左后S公司阿拉斯加州E类E类ITEL公司右后技术信息QSL公司环境影响评价SL公司KKQKA公司SLERQ公司洛杉矶E类T型电气工程师 252
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吉1370470620 384HVREA公司A类S公司YQE公司报警LE公司E类E类G公司SLKD公司电子病历H(H)EYQ公司D类LLNVKLALDIEIATYRKLLEGEE公司N个 444
抄送:pfam00038 253YELQL公司A类D类YQE公司LISE公司LE公司A类E类ETRQ公司电子病历EYQ公司E类LLNVKLALDIEIATYRKLLEGEE公司C类 313
灯丝_头 pfam04732型
中间丝头(DNA结合)区;这个家族代表N端头。。。
4-66 6.32e-08日

中间丝头(DNA结合)区;该家族代表中间丝的N-末端头部区域。中间丝头结合DNA。波形蛋白头部能够改变核结构和染色质分布,HIV-1蛋白酶释放的头部释放可能在HIV-1相关的细胞病变和致癌中发挥重要作用。头部区域的磷酸化会影响灯丝的稳定性。头部与同一蛋白质的杆状结构域相互作用。


Pssm-ID:461414[多域]Cd长度:83  比特分数:50.08  E值:6.32e-08日
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吉1370470620 4右后---T型S公司AA公司SY公司-V(V)SSG公司电磁流量计V(V)--------GGLA公司P(P)GRRLGPGT公司S公司LARMP公司P(P)P(P)PT公司-RV汽车DFSLA公司G公司ALN公司AG公司FK公司E类信托收据 66
抄送:pfam04732 7右后M(M)烟气脱硫S公司S公司不锈钢P(P)SY公司S公司SSG公司SRS系统V(V)固态固态继电器不锈钢P(P)SSSSRRSS系统S公司S公司SRSSY公司P(P)S公司AA公司d日SL公司DFSLA公司D类ALN公司质量工程FK公司A类信托收据 82
Smc公司 COG1196号文件
染色体分离ATP酶Smc[细胞周期控制,细胞分裂,染色体分割]。。。
242-439 4.87e-06

染色体分离ATPase Smc[细胞周期控制,细胞分裂,染色体分配];


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抄送:COG1196   359EL公司不良事件A类--艾勒艾尔A类EAE公司E类E类EELAE公司E类LLEAL公司美国汽车工程师协会AAQ公司LE公司E类欧洲原子能机构E类A类勒勒电气工程师埃莉莉亚拉E类LEEE公司 436
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抄送:COG1196   437E类电子电气设备欧洲经济区EEAAEEEAELEEEEALLEL公司航空公司每个 477
SMC_项目_B 钨极氩弧焊02168
染色体分离蛋白SMC,常见细菌型;SMC(…的结构维护。。。
244-495 1.18e-05

染色体分离蛋白SMC,常见细菌型;SMC(染色体结构维持)蛋白结合DNA,组织和分离染色体以进行分割。SMC蛋白存在于细菌、古菌和真核生物中。该家族代表大多数细菌的SMC蛋白。SMC基因通常与scpB(TIGR00281)和scpA基因相关,其中scp代表分离和浓缩蛋白。SMC在S期早期被诱导,但在整个细胞周期中存在并与DNA结合。【细胞过程、细胞分裂、DNA代谢、染色体相关蛋白】


Pssm-ID:274008[多域]Cd长度:1179  比特分数:48.13  E值:1.18e-05
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抄送:TIGR02168 889法律SELELSEELR公司 904
SMC_行程_B 钨极氩弧焊02168
染色体分离蛋白SMC,常见细菌型;SMC(…的结构维护。。。
70-407 1.67e-05年

染色体分离蛋白SMC,常见细菌型;SMC(染色体结构维持)蛋白结合DNA,组织和分离染色体以进行分割。SMC蛋白存在于细菌、古菌和真核生物中。该家族代表大多数细菌的SMC蛋白。SMC基因通常与scpB(TIGR00281)和scpA基因相关,其中scp代表分离和浓缩蛋白。SMC在S期早期被诱导,但在整个细胞周期中存在并与DNA结合。【细胞过程、细胞分裂、DNA代谢、染色体相关蛋白】


Pssm ID:274008[多域]Cd长度:1179  比特分数:47.74  E值:1.67e-05年
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抄送:TIGR02168 959沥青混合料每个右后RL公司克伦基K(K) 982
Smc公司 COG1196号文件
染色体分离ATP酶Smc[细胞周期控制,细胞分裂,染色体分割]。。。
85-443 1.71e-05

染色体分离ATP酶Smc[细胞周期控制,细胞分裂,染色体分割];


Pssm-ID:440809[多域]Cd长度:983  比特分数:47.62  E值:1.71e-05
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吉1370470620 165美国运通银行洛杉矶AYR公司V(V)revgrggrkglmathpntapklsppeqcaaphcp复仇右后GKA公司天然气E类kepgapvalysspllpl公司定量分析 244
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SMC_行程_B 钨极氩弧焊02168
染色体分离蛋白SMC,常见细菌型;SMC(…的结构维护。。。
242-436 1.12e-04页

染色体分离蛋白SMC,常见细菌型;SMC(染色体结构维持)蛋白结合DNA,组织和分离染色体以进行分割。SMC蛋白存在于细菌、古菌和真核生物中。该家族代表大多数细菌的SMC蛋白。SMC基因通常与scpB(TIGR00281)和scpA基因相关,其中scp代表分离和浓缩蛋白。SMC在S期早期被诱导,但在整个细胞周期中存在并与DNA结合。【细胞过程、细胞分裂、DNA代谢、染色体相关蛋白】


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Smc公司 COG1196号文件
染色体分离ATPase Smc[细胞周期控制,细胞分裂,染色体分配]。。。
249-462 2.56e-04

染色体分离ATP酶Smc[细胞周期控制,细胞分裂,染色体分割];


Pssm-ID:440809[多域]Cd长度:983  比特分数:43.77  E值:2.56e-04
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合同编号4913 合同编号4913
未表征的保守蛋白,包含一个C末端ATP酶域[功能未知];
255-446 2004年7月20日

未表征的保守蛋白,包含一个C末端ATP酶域[功能未知];


Pssm ID:443941[多域]Cd长度:1089  比特分数:43.75  E值:2.70e-04日
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环境委员会 齿轮4942
隔环因子EnvC,鼠蛋白水解酶激活剂AmiA和AmiB[细胞周期控制。。。
242-436 3.89e-04日

隔环因子EnvC、鼠蛋白水解酶激活剂AmiA和AmiB【细胞周期控制、细胞分裂、染色体分割】;


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SMC_行程_B 钨极氩弧焊02168
染色体分离蛋白SMC,常见细菌型;SMC(…的结构维护。。。
117-446 4.18e-04节

染色体分离蛋白SMC,常见细菌型;SMC(染色体结构维持)蛋白结合DNA,组织和分离染色体以进行分割。SMC蛋白存在于细菌、古菌和真核生物中。该家族代表大多数细菌的SMC蛋白。SMC基因通常与scpB(TIGR00281)和scpA基因相关,其中scp代表分离和浓缩蛋白。SMC(在新月杆菌中)在S期早期被诱导,但在整个细胞周期中都存在并与DNA结合。【细胞过程、细胞分裂、DNA代谢、染色体相关蛋白】


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SMC_行程_B 钨极氩弧焊02168
染色体分离蛋白SMC,常见细菌型;SMC(…的结构维护。。。
242-427 4.67e-04页

染色体分离蛋白SMC,常见细菌型;SMC(染色体结构维持)蛋白结合DNA,组织和分离染色体以进行分割。SMC蛋白存在于细菌、古菌和真核生物中。该家族代表大多数细菌的SMC蛋白。SMC基因通常与scpB(TIGR00281)和scpA基因相关,其中scp代表分离和浓缩蛋白。SMC在S期早期被诱导,但在整个细胞周期中存在并与DNA结合。【细胞过程、细胞分裂、DNA代谢、染色体相关蛋白】


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SMC_行程_A 钨极氩弧焊02169
染色体分离蛋白SMC,主要为古菌型;SMC(…的结构维护。。。
67-412 2004年4月7日

染色体分离蛋白SMC,主要为古菌型;SMC(染色体结构维持)蛋白结合DNA,组织和分离染色体以进行分割。SMC蛋白存在于细菌、古菌和真核生物中。它存在于单个拷贝中,在原核生物中是同二聚体,但在真核生物中发现了六个副原核生物(不包括在这个家族中),其中SMC蛋白是异二聚体。该家族代表古生菌和一些细菌(水飞蓟、协同孢子虫等)的SMC蛋白;其他细菌的SMC用TIGR02168描述。该蛋白的N端和C端结构域非常保守,但中心铰链区域的组成偏斜且高度分化。【细胞过程、细胞分裂、DNA代谢、染色体相关蛋白】


Pssm-ID:274009[多域]Cd长度:1164  比特分数:42.36  E值:2004年4月7日
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抄送:TIGR02169 817E类QKLNR公司-----LTLEKEYL公司E类凯奇等式DL公司KEQ公司K(K)S公司E类K(K)工程安装ZH天然气----KKE公司EL公司E类E类E类EELEAAL公司第页D类ESRLG公司DL公司 887
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合同编号4913 合同编号4913
未表征的保守蛋白,包含一个C末端ATP酶域[功能未知];
241-407 7.68e-04页

未表征的保守蛋白,包含一个C末端ATP酶域[功能未知];


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未表征的保守蛋白,包含一个C末端ATP酶域[功能未知];
241-422 9.85e-04号

未表征的保守蛋白,包含一个C末端ATP酶域[功能未知];


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Smc公司 COG1196号文件
染色体分离ATP酶Smc[细胞周期控制,细胞分裂,染色体分割]。。。
63-351 2003年1月30日

染色体分离ATP酶Smc[细胞周期控制,细胞分裂,染色体分割];


Pssm-ID:440809[多域]Cd长度:983  比特分数:41.46  E值:2003年1月30日
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SMC_行程_A 钨极氩弧焊02169
染色体分离蛋白SMC,主要为古菌型;SMC(…的结构维护。。。
242-418 1.35e-03号

染色体分离蛋白SMC,主要为古菌型;SMC(染色体结构维持)蛋白结合DNA,组织和分离染色体以进行分割。SMC蛋白存在于细菌、古菌和真核生物中。它存在于单个拷贝中,在原核生物中是同二聚体,但在真核生物中发现了六个副原核生物(不包括在这个家族中),其中SMC蛋白是异二聚体。该家族代表古生菌和一些细菌(水飞蓟、协同孢子虫等)的SMC蛋白;其他细菌的SMC用TIGR02168描述。这种蛋白质的N端和C端结构域是非常保守的,但中心铰链区的组成是偏斜的,并且高度发散。【细胞过程、细胞分裂、DNA代谢、染色体相关蛋白】


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抄送:TIGR02169 774LHKLEEALN公司DL公司EARLSHS公司里佩质量保证工程师SKLEE公司E类VSRIEAR公司REIEQK公司尼泊尔卢比TLEK公司E类Y(Y)LE公司KEIQ公司E类LQ公司E类-里德凯奇西 852
170       180
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吉1370470620 397ARLE公司E类EGQSL公司K(K)D类E类3月E类YQ公司 418
抄送:TIGR02169 853EKEI公司E类荷兰天然气公司K(K)E类E类LEEE公司E类E类LE公司 874
环境委员会 合同编号4942
隔环因子EnvC,鼠蛋白水解酶激活剂AmiA和AmiB[细胞周期控制。。。
54-173 1.77e-03号

隔环因子EnvC、鼠蛋白水解酶激活剂AmiA和AmiB【细胞周期控制、细胞分裂、染色体分割】;


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抄送:COG4942   10LALAA公司A类阿卡达语A类EAE公司不良事件低爆炸当量QQEI公司A类埃莱凯拉KKEE公司KAL公司LKQ公司AA公司错误国际航空公司ALARRIRALEQ(警报)EL公司AA公司EAE公司不良事件E类 89
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吉1370470620 132ANS公司A类电动汽车E类RDNLAQD公司洛杉矶电视-----QKL公司DETN公司每个E类NN公司A类A类Y(Y) 173
抄送:COG4942   90KEI公司A类E类无线电高度表E类LEAQKEE公司洛杉矶EL公司爱尔兰液化天然气PPLA公司服务提供商E类DF公司D类A类V(V) 136
SMC_行程_B 钨极氩弧焊02168
染色体分离蛋白SMC,常见细菌型;SMC(结构维护。。。
253-491 2.85e-03

染色体分离蛋白SMC,常见细菌型;SMC(染色体结构维持)蛋白结合DNA,组织和分离染色体以进行分割。SMC蛋白存在于细菌、古菌和真核生物中。该家族代表大多数细菌的SMC蛋白。SMC基因通常与scpB(TIGR00281)和scpA基因相关,其中scp代表分离和浓缩蛋白。SMC在S期早期被诱导,但在整个细胞周期中存在并与DNA结合。【细胞过程、细胞分裂、DNA代谢、染色体相关蛋白】


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10 20 30 40 50 60 70 80
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抄送:TIGR02168 236E类卷轴E类E类电气工程师LKEAEEL公司电气工程师长期协议ELQE公司---酒糟EL公司RLEVSE公司EEEIE公司E类LQKELY公司A类A类N个工程安装S公司瑞克奇尔ERL公司A类 312
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吉1370470620 331D类TDAAARNAEL公司RQAKHEANDYRRQ公司质量体系中药LE公司S公司RG公司特内斯勒质量管理要求E类ERHVREA公司A类SYQ公司E类ALA公司RLEE公司环境质量体系KDEM公司 410
抄送:TIGR02168 313N个ERQLEELEAQ公司EELESKLDELAEE公司不良事件EEK公司LE公司E类-------ELESL公司E类埃雷尔A类电气工程师E类莱斯RLEE公司----EEQL公司 381
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吉1370470620 411ARHLQEYQD公司LNVKLA公司设计院工程安装ATYRKL公司LE公司通用电气公司E类N个ITIPV公司TFSN公司QIRETSLDT公司K(K)SVSEGHLKRNIVKTVEMRDGEVIK公司 490
抄送:TIGR02168 382etlrsvaq公司ELQIAS公司NN公司工程安装ERLEAR公司LE公司RL公司E类D类RERLQ公司电子工程师LKLEEAEL公司K(K)ELQAELELEELEELQEELELE公司 461

.
吉1370470620 491E类 491
抄送:TIGR02168 462A类 462
Smc公司 COG1196号文件
染色体分离ATP酶Smc[细胞周期控制,细胞分裂,染色体分割]。。。
86-428 2003年5月5日

染色体分离ATP酶Smc[细胞周期控制,细胞分裂,染色体分割];


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抄送:COG1196   233K(K)E类LE公司AELEE公司E类美国运通电气工程师E类A类EL公司-----EELE公司美国运通A类EL公司EAE公司电气工程师雷利(RLELEE)LE公司E类利亚凯耶拉阿雷克二醛 307
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抄送:COG1196   341E类李埃莱雅E类EEL公司E类每个E类A类E类莱艾艾尔E类澳大利亚能源局EL公司A类E类埃埃利埃拉E类ELLEALRAA公司A类E类AAQLEEL公司E类EAEEALLERL公司E类RLE公司 420
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吉1370470620 406KDEM公司A类RHLQEYQDLLNVK公司ALD公司 428
抄送:COG1196   496LEAE公司A类戴格弗列格夫卡尔滞后,滞后 518
46 PHA02562型
核酸内切酶亚基;临时的
231-416年 5.09e-03年5月

核酸内切酶亚基;临时的


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抄送:PHA02562  197IKT公司Y(Y)NKNIEEQRKKNGENI公司应收账K(K)--质量nK(K)YDE公司V(V)电气工程师A类----K(K)TIKA公司E类工业工程EL公司TDE公司------N个VMDIE公司D类PS(聚苯乙烯)AAL公司NKLN公司T型AA公司 264
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爆破搜索参数
数据来源: 预计算数据,版本=cdd.v.3.21
预设选项:数据库:CDSEARCH/光盘低复杂性过滤器:没有基于成分的调整:是的E值阈值: 0.01

参考文献:

  • 王杰等(2023),“2023年的保守域数据库”,核酸研究51(D) 公元384-388年。
  • Lu S等人(2020),“2020年的保守域数据库”,核酸研究48(D) 265-8。
  • Marchler-Bauer A等人(2017年),“CDD/SPARCLE:通过亚家族结构域对蛋白质进行功能分类。”,核酸研究45(D) 2003年3月。
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