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胶质纤维酸性蛋白亚型1[小家鼠]

蛋白质分类

中间丝族蛋白(域体系结构ID 12057329)

中间丝族蛋白类似于结蛋白,结蛋白是一种肌肉特异性III型中间丝,对肌肉的正常结构和功能至关重要

图形摘要

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姓名 加入 描述 间隔 E值
长丝 pfam00038型
中间丝蛋白;
65-373 1.16年-125年

中间丝蛋白;


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Pssm-ID:459643[多域]Cd长度:313  比特分数:366.17  E值:1.16e-125
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灯丝_头 pfam04732型
中间丝头(DNA结合)区;这个系列代表N端子头。。。
4-63 1.87e-07号

中间丝头(DNA结合)区;该家族代表中间丝的N末端头部区域。中间丝头结合DNA。波形蛋白头部能够改变核结构和染色质分布,HIV-1蛋白酶释放的头部释放可能在HIV-1相关的细胞病变和致癌中发挥重要作用。头部区域的磷酸化会影响灯丝的稳定性。头部已被证明与同一蛋白质的杆状结构域相互作用。


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中间丝蛋白;


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Smc公司 COG1196号文件
染色体分离ATP酶Smc[细胞周期控制,细胞分裂,染色体分割]。。。
82-372 3.55e-12页

染色体分离ATP酶Smc[细胞周期控制,细胞分裂,染色体分割];


Pssm-ID:440809[多域]Cd长度:983  比特分数:68.42  E值:3.55e-12页
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SMC_项目_B 老虎02168
染色体分离蛋白SMC,常见细菌型;SMC(…的结构维护。。。
53-375 1.70e-11日

染色体分离蛋白SMC,常见细菌型;SMC(染色体结构维持)蛋白结合DNA,组织和分离染色体以进行分割。SMC蛋白存在于细菌、古菌和真核生物中。该家族代表大多数细菌的SMC蛋白。SMC基因通常与scpB(TIGR00281)和scpA基因相关,其中scp代表分离和浓缩蛋白。SMC在S期早期被诱导,但在整个细胞周期中存在并与DNA结合。【细胞过程、细胞分裂、DNA代谢、染色体相关蛋白】


Pssm-ID:274008[多域]Cd长度:1179  比特分数:66.23  E值:1.70e-11日
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吉196115327  364莱根(RKLLEGEEN)信息技术 375
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灯丝_头 pfam04732型
中间丝头(DNA结合)区;这个系列代表N端子头。。。
4-63 1.87e-07号

中间丝头(DNA结合)区;该家族代表中间丝的N末端头部区域。中间丝头结合DNA。波形蛋白头部能够改变核结构和染色质分布,HIV-1蛋白酶释放的头部释放可能在HIV-1相关的细胞病变和致癌中发挥重要作用。头部区域的磷酸化会影响灯丝的稳定性。头部与同一蛋白质的杆状结构域相互作用。


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PRK02224号 PRK02224号
DNA双链断裂修复;Rad50-ATPase;
88-351 5.48e-04页

DNA双链断裂修复;Rad50-ATPase;


Pssm-ID:179385[多域]Cd长度:880  比特分数:42.33  E值:5.48e-04页
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姓名 加入 描述 间隔 E值
长丝 pfam00038型
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Smc公司 COG1196号文件
染色体分离ATP酶Smc[细胞周期控制,细胞分裂,染色体分割]。。。
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染色体分离ATP酶Smc[细胞周期控制,细胞分裂,染色体分割];


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SMC_行程_B 钨极氩弧焊02168
染色体分离蛋白SMC,常见细菌型;SMC(结构维护。。。
53-375 1.70e-11日

染色体分离蛋白SMC,常见细菌型;SMC(染色体结构维持)蛋白结合DNA,组织和分离染色体以进行分割。SMC蛋白存在于细菌、古菌和真核生物中。该家族代表大多数细菌的SMC蛋白。SMC基因通常与scpB(TIGR00281)和scpA基因相关,其中scp代表分离和浓缩蛋白。SMC在S期早期被诱导,但在整个细胞周期中存在并与DNA结合。【细胞过程、细胞分裂、DNA代谢、染色体相关蛋白】


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SMC_行程_B 钨极氩弧焊02168
染色体分离蛋白SMC,常见细菌型;SMC(…的结构维护。。。
65-311 2.76e-10

染色体分离蛋白SMC,常见细菌型;SMC(染色体结构维持)蛋白结合DNA,组织和分离染色体以进行分割。SMC蛋白存在于细菌、古菌和真核生物中。该家族代表大多数细菌的SMC蛋白。SMC基因通常与scpB(TIGR00281)和scpA基因相关,其中scp代表分离和浓缩蛋白。SMC在S期早期被诱导,但在整个细胞周期中存在并与DNA结合。【细胞过程、细胞分裂、DNA代谢、染色体相关蛋白】


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Smc公司 COG1196号文件
染色体分离ATP酶Smc[细胞周期控制,细胞分裂,染色体分割]。。。
113至374 2.98e-10

染色体分离ATP酶Smc[细胞周期控制,细胞分裂,染色体分割];


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Smc公司 COG1196号文件
染色体分离ATP酶Smc[细胞周期控制,细胞分裂,染色体分割]。。。
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染色体分离ATP酶Smc[细胞周期控制,细胞分裂,染色体分割];


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SMC_行程_B 钨极氩弧焊02168
染色体分离蛋白SMC,常见细菌型;SMC(…的结构维护。。。
83-372 4.67e-08年

染色体分离蛋白SMC,常见细菌型;SMC(染色体的结构维持)蛋白结合DNA并参与组织和分离染色体以进行分配。SMC蛋白存在于细菌、古菌和真核生物中。该家族代表大多数细菌的SMC蛋白。SMC基因通常与scpB(TIGR00281)和scpA基因相关,其中scp代表分离和浓缩蛋白。SMC在S期早期被诱导,但在整个细胞周期中存在并与DNA结合。【细胞过程、细胞分裂、DNA代谢、染色体相关蛋白】


Pssm-ID:274008[多域]Cd长度:1179  比特分数:55.45  E值:4.67e-08年
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吉196115327  312------E类拉哈尔E类SASY公司质量工程A类L(左)A类RLEE公司EGQS公司L(左)K(K)电气工程师马勒EYQDLLNVKLA公司L(左)DIEIATYRK公司L(左)L(左)E类通用电气公司E类N个 372
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环境委员会 合同编号4942
隔环因子EnvC,鼠蛋白水解酶激活剂AmiA和AmiB[细胞周期控制。。。
114-341 2007年4月24日

隔环因子EnvC、鼠蛋白水解酶激活剂AmiA和AmiB【细胞周期控制、细胞分裂、染色体分割】;


Pssm-ID:443969[多域]Cd长度:377  比特分数:53.23  E值:2007年4月24日
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灯丝_头 pfam04732型
中间丝头(DNA结合)区;这个系列代表N端子头。。。
4-63 1.87e-07号

中间丝头(DNA结合)区;该家族代表中间丝的N末端头部区域。中间丝头结合DNA。波形蛋白头部能够改变核结构和染色质分布,HIV-1蛋白酶释放的头部释放可能在HIV-1相关的细胞病变和致癌中发挥重要作用。头部区域的磷酸化会影响灯丝的稳定性。头部与同一蛋白质的杆状结构域相互作用。


Pssm-ID:461414[多域]Cd长度:83  比特分数:48.54  E值:1.87e-07号
10 20 30 40 50 60 70 80
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吉196115327  62信托收据 63
抄送:pfam04732 81信托收据 82
SMC_行程_A 钨极氩弧焊02169
染色体分离蛋白SMC,主要为古菌型;SMC(…的结构维护。。。
60-341 9月53日-07日

染色体分离蛋白SMC,主要为古菌型;SMC(染色体结构维持)蛋白结合DNA,组织和分离染色体以进行分割。SMC蛋白存在于细菌、古菌和真核生物中。它存在于单个拷贝中,在原核生物中是同二聚体,但在真核生物中发现了六个副原核生物(不包括在这个家族中),其中SMC蛋白是异二聚体。该家族代表古生菌和一些细菌(水飞蓟、协同孢子虫等)的SMC蛋白;其他细菌的SMC用TIGR02168描述。该蛋白的N端和C端结构域非常保守,但中心铰链区域的组成偏斜且高度分化。【细胞过程、细胞分裂、DNA代谢、染色体相关蛋白】


Pssm-ID:274009[多域]Cd长度:1164  比特分数:51.22  E值:9月53日-07日
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吉196115327  60凯特拉塞拉E类MM(毫米)EL公司ND(无损检测)时尚E类千伏射频LE公司QQNKA公司L(左)A类A类E类L(左)NQL公司阿拉斯加州E类PTKLADVYQA公司E类LRELRL公司RL公司DQLTANSA公司RL公司电动汽车E类研发 139
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抄送:TIGR02169 965欧洲投资监管局L(左)EPV公司N个MLAIQEYE公司E类VLK公司劳埃德----ELK公司E类韩国A类K(K)LEEE公司RKAIL公司E类RIEE公司 1011
环境委员会 合同编号4942
隔环因子EnvC,鼠蛋白水解酶激活剂AmiA和AmiB[细胞周期控制。。。
137-365 2006年3月31日

隔环因子EnvC、鼠蛋白水解酶激活剂AmiA和AmiB【细胞周期控制、细胞分裂、染色体分割】;


Pssm-ID:443969[多域]Cd长度:377  比特分数:49.38  E值:2006年3月31日
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邮编:COG4942  167不良事件L(左)EAERAE公司LE公司ALLA公司E类L(左)电气工程师急诊室A类A类利亚斯里兰卡A类急诊室吉隆坡大型K(K)E类拉丁美洲L(左)AA公司E类L(左)A类ELQ公司质量工程AEE公司L(左)EALIAR公司L(左)每个E类A类A类美国汽车工程师协会 241
SMC_行程_A 钨极氩弧焊02169
染色体分离蛋白SMC,主要为古菌型;SMC(…的结构维护。。。
113-368 2006年3月20日

染色体分离蛋白SMC,主要为古菌型;SMC(染色体结构维持)蛋白结合DNA,组织和分离染色体以进行分割。SMC蛋白存在于细菌、古菌和真核生物中。它存在于单个拷贝中,在原核生物中是同二聚体,但在真核生物中发现了六个副原核生物(不包括在这个家族中),其中SMC蛋白是异二聚体。该家族代表古生菌和一些细菌(水飞蓟、协同孢子虫等)的SMC蛋白;其他细菌的SMC用TIGR02168描述。该蛋白的N端和C端结构域非常保守,但中心铰链区域的组成偏斜且高度分化。【细胞过程、细胞分裂、DNA代谢、染色体相关蛋白】


Pssm-ID:274009[多域]Cd长度:1164  比特分数:49.68  E值:2006年3月20日
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抄送:TIGR02169 902埃尔基埃L(左)EAQ公司EKK公司韩国L(左)S公司 920
SMC_行程_B 老虎02168
染色体分离蛋白SMC,常见细菌型;SMC(…的结构维护。。。
59-264 1.10e-05日

染色体分离蛋白SMC,常见细菌型;SMC(染色体的结构维持)蛋白结合DNA并参与组织和分离染色体以进行分配。SMC蛋白存在于细菌、古菌和真核生物中。该家族代表大多数细菌的SMC蛋白。SMC基因通常与scpB(TIGR00281)和scpA基因相关,其中scp代表分离和浓缩蛋白。SMC在S期早期被诱导,但在整个细胞周期中存在并与DNA结合。【细胞过程、细胞分裂、DNA代谢、染色体相关蛋白】


Pssm-ID:274008[多域]Cd长度:1179  比特分数:47.74  E值:1.10e-05日
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吉196115327  217甚高频E类M(M)D类VAK公司LTAA公司L(左)房地产年N个M(M)------E类TE公司E类W公司Y(Y)---SKFA公司DLT公司D类A类 264
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齿轮4913 合同编号4913
未表征的保守蛋白,包含一个C末端ATP酶域[功能未知];
51-215 1.45e-05年

未表征的保守蛋白,包含一个C末端ATP酶域[功能未知];


Pssm-ID:443941[多域]Cd长度:1089  比特分数:47.60  E值:1.45e-05年
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未表征的保守蛋白,包含一个C末端ATP酶域[功能未知];
67-305 2.53e-05

未表征的保守蛋白,包含一个C末端ATP酶域[功能未知];


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SMC_行程_B 钨极氩弧焊02168
染色体分离蛋白SMC,常见细菌型;SMC(…的结构维护。。。
159-374 5.28e-05

染色体分离蛋白SMC,常见细菌型;SMC(染色体结构维持)蛋白结合DNA,组织和分离染色体以进行分割。SMC蛋白存在于细菌、古菌和真核生物中。该家族代表大多数细菌的SMC蛋白。SMC基因通常与scpB(TIGR00281)和scpA基因相关,其中scp代表分离和浓缩蛋白。SMC在S期早期被诱导,但在整个细胞周期中存在并与DNA结合。[细胞过程、细胞分裂、DNA代谢、染色体相关蛋白]


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合同编号4913 齿轮4913
未表征的保守蛋白,包含一个C末端ATP酶域[功能未知];
68-243 2005年8月39日

未表征的保守蛋白,包含一个C末端ATP酶域[功能未知];


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线圈结构域蛋白158;CCDC158是真核生物中发现的一个蛋白质家族。。。
58-353 2009年4月3日

线圈结构域蛋白158;CCDC158是真核生物中发现的一个蛋白质家族。功能未知。


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未表征的保守蛋白,包含一个C末端ATP酶域[功能未知];
170-368 3.23e-04日

未表征的保守蛋白,包含一个C末端ATP酶域[功能未知];


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DNA双链断裂修复;Rad50-ATPase;


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Smc公司 COG1196号文件
染色体分离ATP酶Smc[细胞周期控制,细胞分裂,染色体分割]。。。
161-374 2004年7月40日

染色体分离ATP酶Smc[细胞周期控制,细胞分裂,染色体分割];


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环境委员会 合同编号4942
隔环因子EnvC,鼠蛋白水解酶激活剂AmiA和AmiB[细胞周期控制。。。
60-318 7.64e-04页

隔环因子EnvC、鼠蛋白水解酶激活剂AmiA和AmiB【细胞周期控制、细胞分裂、染色体分割】;


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吉196115327 299TNES公司LE公司RQMREQUE公司急诊室野兔 318
抄送:COG4942  228说谎者LE公司美国航空航天协会急诊室吨包装 247
齿轮4913 合同编号4913
未表征的保守蛋白,包含一个C末端ATP酶域[功能未知];
166-375 1.48e-03年

未表征的保守蛋白,包含一个C末端ATP酶域[功能未知];


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COG2433公司 齿轮2433
RNase H折叠的可能核酸酶,RuvC/YqgF家族[仅用于一般功能预测];
94-214 1.70e-03日

核糖核酸酶H折叠,RuvC/YqgF家族的可能核酸酶【仅用于一般功能预测】;


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邮编:COG2433  456E类错误----EIRKD公司环境影响报告L(左)博士工程安装急诊室L(左)EREL公司电子电气设备里尔工业工程EL公司韩国L(左)急诊室 497
氯丙酸 COG0542号机组
ATP-依赖性Clp蛋白酶,ATP-结合亚单位ClpA[翻译后修饰,蛋白质。。。
131-252 2003年2月23日

ATP-依赖性Clp蛋白酶,ATP-结合亚单位ClpA[翻译后修饰,蛋白质周转,伴侣];


Pssm-ID:440308[多域]Cd长度:836  比特分数:40.45  E值:2003年2月23日
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抄送:COG0542  472E类IQELKEELEQRYGKI公司P(P)E类L(左)EKE公司L(左)A类E类利埃莱尔A类PLLRE公司E类v(v)球座 515
树胶C COG3206号机组
胞外多糖输出蛋白/结构域GumC/Wzc1[细胞壁/膜/包膜生物发生];
108-330 2.33e-03号

胞外多糖输出蛋白/结构域GumC/Wzc1[细胞壁/膜/包膜生物发生];


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合同编号4913 合同编号4913
未表征的保守蛋白,包含一个C末端ATP酶域[功能未知];
113-331 2.34e-03号

未表征的保守蛋白,包含一个C末端ATP酶域[功能未知];


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Smc公司 COG1196号文件
染色体分离ATP酶Smc[细胞周期控制,细胞分裂,染色体分割]。。。
61-376 4.57e-03页

染色体分离ATP酶Smc[细胞周期控制,细胞分裂,染色体分割];


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330 340
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抄送:COG1196  712爱尔丽E类ELEEA公司L(左)E类E类QL公司E类AEREE公司 736
SMC_行程_A 钨极氩弧焊02169
染色体分离蛋白SMC,主要为古菌型;SMC(…的结构维护。。。
57-220 5.88e-03号

染色体分离蛋白SMC,主要为古菌型;SMC(染色体结构维持)蛋白结合DNA,组织和分离染色体以进行分割。SMC蛋白存在于细菌、古菌和真核生物中。它存在于单个拷贝中,在原核生物中是同二聚体,但在真核生物中发现了六个副原核生物(不包括在这个家族中),其中SMC蛋白是异二聚体。该家族代表古生菌和一些细菌(水飞蓟、协同孢子虫等)的SMC蛋白;其他细菌的SMC用TIGR02168描述。该蛋白的N端和C端结构域非常保守,但中心铰链区域的组成偏斜且高度分化。【细胞过程、细胞分裂、DNA代谢、染色体相关蛋白】


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抄送:TIGR02169 419东南方E类拉丁美洲K(K)INELEEKEDKALEIKKQEWKLEQLAADLSKY公司E类QELYD公司L(左)K(K)电气工程师YDRVE公司K(K)ELSKLQ公司REL公司A类E类不良事件逆商 498

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吉196115327  215QQVHV公司E类 220
抄送:TIGR02169 499阿糖胞苷酶E类 504
MukB公司 齿轮3096
染色体凝聚蛋白MukBEF、ATP酶和DNA-结合亚单位MukB[细胞周期控制,细胞。。。
85-208 2003年7月45日

染色体凝聚蛋白MukBEF、ATP酶和DNA-结合亚单位MukB【细胞周期控制、细胞分裂、染色体分割】;


Pssm-ID:442330[多域]Cd长度:1470  比特分数:38.78  E值:2003年7月45日
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抄送:COG3096  606aaqdaler公司L(左)REQSGEA公司L(左)ADSQEVT公司A类上午QL公司-------LER公司急诊室EATVERD公司E类LAARKQAL公司E类SQIER公司L(左) 663
树胶C COG3206号机组
胞外多糖输出蛋白/结构域GumC/Wzc1[细胞壁/膜/包膜生物发生];
183-374 8.75e-03号

胞外多糖输出蛋白/结构域GumC/Wzc1[细胞壁/膜/包膜生物发生];


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吉196115327 183LE公司遥控门锁E类SLEEIQ公司佛罗里达州rkiy公司电气工程师EVR公司ELR公司均衡L(左)AQQQ(AQQ)vhvemdvakpdlt软件AAL公司E类TQYEA公司V(V)自动变速箱S公司NMQET公司电子战YRSKFAD公司L(左) 262
合同编号:COG3206  166LRR公司E类EARKALE公司佛罗里达州----电气工程师昆士兰州ELR公司韩国L(左)欧洲原子能机构-------------AAL公司E类E类F类QKNGL公司V(V)DL公司S公司EEAKL公司---LLQQLSE有限责任公司L(左)E类 225
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吉196115327 263DAASRNAEL公司L(左)RQ(请求)A类凯恩迪QL公司QALTCD公司---------莱斯左后GTNES公司LE公司RQMR公司E类质量工程HARESASYQEAL公司A类雷埃格(RLEEEGQ) 333
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吉196115327 334S公司L(左)韩国E类妈妈H(H)L(左)数量动态链接库无功功率美国铝业公司DIEI公司A类TYRKL公司L(左)EGE公司E类N个 374
抄送:COG3206  306L(左)QQ(QQ)E类逆商L(左)ASLE公司---AELE公司美国铝业公司卡塔尔共和国A类SLQAQ公司L(左)AQL公司E类A类L(左) 343
COG1340公司 COG1340公司
未表征的线圈蛋白,包含DUF342结构域[功能未知];
61-345 9.75e-03号

未表征的线圈蛋白,包含DUF342结构域[功能未知];


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吉196115327 61电子技术EL公司发改委E类千伏射频L(左)EQQNKA公司L(左)AA公司EL公司NQ公司L(左)无线电高度表K(K)EPTKL公司A类D类V(V)YQ公司--A类E类左后ELR公司LRL公司D类L(左)TANSAR公司L(左)电动汽车急诊室 138
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90       100       110       120       130       140       150       160
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爆破搜索参数
数据来源: 预计算数据,版本=cdd.v.3.21
预设选项:数据库:CDSEARCH/光盘低复杂性过滤器:没有基于成分的调整:是的E值阈值: 0.01

参考文献:

  • 王杰等(2023),“2023年的保守域数据库”,核酸研究51(D) 公元384-388年。
  • Lu S等人(2020),“2020年的保守域数据库”,核酸研究48(D) 265-8。
  • Marchler-Bauer A等人(2017年),“CDD/SPARCLE:通过亚家族结构域对蛋白质进行功能分类。”,核酸研究45(D) 2003年3月。
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