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核衣壳[人类免疫缺陷病毒1]

蛋白质分类

CCHC型锌指蛋白(域体系结构ID 1000253)

CCHC型锌指蛋白类似于人类细胞核酸结合蛋白,是一种单链DNA结合蛋白,优先与固醇调节元件(SRE)序列5'-GTGGGTG-3'结合,从而介导转录抑制

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姓名 加入 描述 间隔 E值
PTZ00368超级系列 cl31762号
通用小圆序列结合蛋白(UMSBP);临时的
7-52 7.69e-06页

通用小圆序列结合蛋白(UMSBP);临时的


检测到与超家族成员的实际对齐PTZ00368型以下为:

Pssm-ID:173561[多域]Cd长度:148  比特分数:39.79  E值:7.69e-06页
10        20        30        40        50
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吉19172949  7RNQRKIVK公司C类F类NCG公司KEGH公司助教R(右)N个C类RAPR(RAPR)K公斤-----C类WK公司CG公司韩国GH公司QMK公司直流TER公司 52
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姓名 加入 描述 间隔 E值
PTZ00368型 电话:00368
通用小圆序列结合蛋白(UMSBP);临时的
7-52 7.69e-06页

通用小圆序列结合蛋白(UMSBP);临时的


Pssm-ID:173561[多域]Cd长度:148  比特分数:39.79  E值:7.69e-06页
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空气调节器1 COG5082公司
精氨酸甲基转移酶相互作用蛋白,含有RING-Zn-finger[翻译后。。。
14-52 2.00e-03年

精氨酸甲基转移酶相互作用蛋白,含有RING-Zn-finger[翻译后修饰,蛋白质周转,伴侣/细胞内运输和分泌];


Pssm-ID:227414[多域]Cd长度:190  比特分数:33.67  E值:2003年2月2日
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抄送:COG5082 62V(V)CFNCG公司QN(质量)GH公司左后R(右)D类C类酸碱度---C类YN公司C类SWD公司GH公司RSNH公司C类巴基斯坦国家石油公司 97
 
姓名 加入 描述 间隔 E值
PTZ00368型 电话:00368
通用小圆序列结合蛋白(UMSBP);临时的
7-52 7.69e-06页

通用小圆序列结合蛋白(UMSBP);临时的


Pssm-ID:173561[多域]Cd长度:148  比特分数:39.79  E值:7.69e-06页
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吉19172949  7RNQRKIVK公司C类F类NCG公司KEGH公司助教R(右)N个C类RAPR(RAPR)K公斤-----C类WK公司CG公司韩国GH公司QMK公司直流TER公司 52
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电话:00368 PTZ00368型
通用小圆序列结合蛋白(UMSBP);临时的
15-53 7.67e-05年

通用微环序列结合蛋白(UMSBP);临时的


Pssm-ID:173561[多域]Cd长度:148  比特分数:37.09  E值:7.67e-05年
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吉19172949  15C类FN公司CG公司韩国GH公司助教R(右)N个C类RAPRKG公司----C类工作CGK公司电子GH公司QMKD公司C类T型电子RQ(请求) 53
抄送:PTZ00368 30C类YK公司CG公司欧洲药典GH公司LS(负载感应)R(右)电子C类PSAPGGR公司格尔斯C类YN公司CGK公司T型GH公司LSRE公司C类电子应用程序 72
PTZ00368型 PTZ00368型
通用小圆序列结合蛋白(UMSBP);临时的
13-49 8月17日至05日

通用小圆序列结合蛋白(UMSBP);临时的


Pssm-ID:173561[多域]Cd长度:148  比特分数:37.09  E值:8月17日至05日
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吉19172949  13VK公司C类F类NCG公司韩国GH公司助教R(右)N个C类RAPR(RAPR)KK-----C类WK公司CG公司K电子政务QMK公司直流 49
抄送:PTZ00368 78RS系列C类Y(Y)NCG公司QT公司GH公司R(右)电子C类PNRA公司K阿拉C类CG公司EGH公司情报、监视与侦察直流 119
PTZ00368型 PTZ00368型
通用小圆序列结合蛋白(UMSBP);临时的
15-55 2.32e-04日

通用小圆序列结合蛋白(UMSBP);临时的


Pssm-ID:173561[多域]Cd长度:148个比特分数:35.94  E值:2.32e-04日
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吉19172949  15C类F类NCGK公司电子GH公司助教R(右)N个C类RAPRKG公司----C类WK公司CG公司韩国GH公司QMKD公司C类TE公司R(右)QAN(质量保证编号) 55
抄送:PTZ00368 55C类Y(Y)NCGK公司T型GH公司LS(负载感应)R(右)电子C类PEAPPGS公司全球定位系统C类YN公司CG公司QT公司GH公司以色列可再生能源公司C类PN编号R(右)AKG公司 99
PTZ00368型 PTZ00368型
通用小圆序列结合蛋白(UMSBP);临时的
15-53 7.61e-04页

通用小圆序列结合蛋白(UMSBP);临时的


Pssm-ID:173561[多域]Cd长度:148  比特分数:34.40  E值:2004年6月1日
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吉19172949  15C类FN公司CG公司韩国GH公司助教R(右)N个C类RAPRKK公司------C类W公司千立方厘米韩国GH公司QMKD公司C类TERQ公司 53
抄送:PTZ00368 C类CG公司全球价值GH公司质量保证R(右)电子C类PNSAPA公司阿卡普C类Y(Y)KCG公司欧洲药典GH公司LSRE公司C类PSAP公司 47
空气调节器1 COG5082公司
精氨酸甲基转移酶相互作用蛋白,含有RING-Zn-finger[翻译后。。。
14-52 2.00e-03年

精氨酸甲基转移酶相互作用蛋白,含有RING-Zn-finger[翻译后修饰,蛋白质周转,伴侣/细胞内运输和分泌];


Pssm-ID:227414[多域]Cd长度:190  比特分数:33.67  E值:2.00e-03年
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吉19172949 14KCFNCG公司韩国GH公司助教R(右)N个C类无线电高度表prk公司公斤C类WK公司C类GKE公司GH公司QMKD公司C类TER公司 52
抄送:COG5082 62V(V)CFNCG公司QN(质量)GH公司左后R(右)D类C类酸碱度---C类YN公司C类SWD公司GH公司RSNH公司C类巴基斯坦国家石油公司 97
 
爆破搜索参数
数据来源: 预计算数据,版本=cdd.v.3.21
预设选项:数据库:CDSEARCH/光盘低复杂性过滤器:没有基于成分的调整:是的E值阈值: 0.01

参考文献:

  • 王杰等(2023),“2023年的保守域数据库”,核酸研究51(D) 公元384-388年。
  • Lu S等人(2020),“2020年的保守域数据库”,核酸研究48(D) 265-8。
  • Marchler-Bauer A等人(2017年),“CDD/SPARCLE:通过亚家族结构域对蛋白质进行功能分类。”,核酸研究45(D) 2003年3月。
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