 研究概述 |
该网站目前由Michael Y.Galperin维护(个人简历,出版物,短生物)并描述了由尤金·库宁的研究小组在NCBI计算生物学分支. 主要成果包括： -基于多种计算机分析的蛋白质功能预测
-蛋白质同源群簇的划分
-某些生化途径的重建
-各种细菌和古菌的信号转导系统分析
| 工具书类 |
1.书序列-进化-功能。计算方法比较基因组学由E.V.Koonin和M.Y.Galperin出版2002年10月，由波士顿Kluwer学术出版社出版（目前施普林格).
这个这本书的全文现在免费提供关于NCBI书架. 一些相关论文（点击这里有完整的清单):
基因组注释 1.Tatusov R.L.、Galperin M.Y.、Natale D.A.和Koonin E.V.（2000）COG数据库：蛋白质功能和进化的基因组尺度分析工具.核酸研究。28: 33-36.摘要.全文（PDF）. 2.Galperin M.Y.和Koonin E.V.（2000）谁是你的邻居？功能基因组学的新计算方法。 自然生物技术。 18: 609-613.摘要.请求重印. 3.Galperin M.Y.、Moroz O.V.、Wilson K.S.和Murzin A.G.（2006）打扫房间是做好家务的一部分。 摩尔微生物。 59: 5-19.摘要.全文（HTML）.全文（PDF）. 4.Galperin M.Y.和Koonin E.V.（2010年）从完整的基因组序列到“完全”理解？ 生物技术趋势。 28: 398-406.摘要.文章大纲
全文（PDF）.5.Galperin M.Y.、Makarova K.S.、Wolf Y.I.和Koonin E.V.（2015）扩大了COG数据库中微生物基因组的覆盖范围并改进了蛋白质家族注释。 核酸研究。 43：D261-D269。摘要.全文.
进化 1.Mulkidjanian A.Y.、Cherepanov D.A.和Galperin M.Y.（2003）适者生存：选择第一个紫外光照射下的寡核苷酸类聚合物。 BMC进化生物学。 3: 12.摘要.全文（HTML）.全文（PDF）. 2.Mulkidjanian A.Y.、Makarova K.S.、Galperin M.Y.和Koonin E.V.（2007）发明发电机：F型和V型ATP酶的进化。 《自然·微生物学评论》。 5: 892-899.摘要.请求重印.3.穆尔基德詹扬（Mulkidjanian A.Y.）和加尔佩林（Galperin M.Y.）（2009）关于锌世界中生命的起源。2.验证了光合作用硫化锌建筑物作为地球生命摇篮的假说。 生物学指导 4: 27.摘要.全文. Omelchenko M.V.、Galperin M.Y.、Wolf Y.I.和Koonin E.V.（2010年）非同源异能酶：酶进化中替代溶液的系统分析。 生物学指导 5：31。摘要.全文. 5.Mulkidjanian A.Y、Bychkov A.Y.、Dibrova D.V.、Galperin M.Y.和Koonin E.V.（2012）陆地缺氧地热田第一细胞的起源 《美国科学院院刊》 109：E821-E830。摘要.全文. 信号转导 1.Galperin M.Y.（2004）基因组视角下的细菌信号转导网络。 环境。微生物。 6: 552-567.摘要.全文（HTML）.全文（PDF）. 2.Galperin M.Y.（2005）细菌膜结合和细胞内信号转导蛋白普查：细菌智商、外向型和内向型。 BMC微生物。 5: 35.摘要.全文（HTML）.全文（PDF）. 3.Galperin M.Y.和Gomelsky M.（2005）细菌信号转导模块：从基因组学到生物学。 ASM新闻 71: 326-333.全文（PDF）. 4.Romling U.、Gomelsky M.和Galperin M.Y.（2005）C-di-GMP：一种新型细菌信号系统的曙光。 摩尔微生物。 57: 629-639.摘要.全文（HTML）.全文（PDF）. 5.Amikam D.和Galperin M.Y.（2006年）PilZ结构域是细菌c-di-GMP结合蛋白的一部分。 生物信息学 22: 3-6.摘要.全文（HTML）.全文（PDF）.6.Galperin M.Y.（2006）细菌反应调节器的结构分类：输出域和域组合的多样性.《细菌学杂志》。 188: 4169-4182.摘要.全文（HTML）.补充表. 7.Galperin M.Y.（2010）响应调节器输出域结构和功能的多样性.货币。操作。微生物。 13: 150-159.摘要.文章大纲.全文（PDF）.补充表. 8.Römling U.、Galperin M.Y.和Gomelsky M.（2013）环状二GMP：通用细菌第二信使的前25年。 微生物分子生物学评论。 77: 1-52.摘要.全文（HTML）.全文（PDF）. 9.Chou S.-H.和Galperin M.Y.（2016）环状双GMP结合蛋白的多样性和机制。 细菌杂志。 198: 32-46.摘要.全文.请求重印. 10.王毅C.、金K.H.、涂Z.L.、何J.、Jones C.J.、Zamorano Sanchez D.、Yildiz F.H.、Galperin M.Y.和Chou S.-H.（2016）广泛存在的高亲和力环状双GMP受体MshEN结构域结合核苷酸。 自然社区。 7: 12481.摘要.全文（HTML）.全文（PDF）.
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