MGI根据来自基因组资源联盟. 联盟设置基于联盟与DIOPT公司.

MGI包括联盟中以下脊椎动物物种的正形学：
-人类
-鼠标
-老鼠
-斑马鱼

这些是联盟中代表的总物种的子集；可能有严格的设置其他联盟物种的直系祖先。