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酶数据库
- EBI酶入口
- 探索酶:提供访问国际生物化学和分子生物学联合会(IUBMB)酶命名表数据的资源,并保持IUPAC化学名称的标准格式。
- 磷网站+:一个由专家管理的数据库,提供对研究激肽组蛋白质体内翻译后修饰有用的信息和工具。
Transporter数据库
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基因/蛋白质数据库
- 基因卡:一个可搜索的综合数据库,提供所有已知和预测人类基因的简明基因组相关信息。包括马拉卡德,人类疾病数据库。请注意,GeneCards免费用于学术和非营利用途,但商业用户需要许可证。
- InterPro公司:将来自几个相关数据库的蛋白质信息集成到一个可搜索的资源中,提供蛋白质家族分类信息、功能域预测和蛋白质上其他重要位点的识别。
- 同源基因:一个从广泛的真核生物物种基因组构建假定同源群的自动化系统。
- HUGO基因命名委员会(HGNC)
- KEGG公司:京都基因和基因组百科全书
- neXt代理:一个以人类蛋白质为中心的知识库,提供对一系列高质量数据集的访问以及挖掘工具。
- Pfam公司:蛋白质家族的集合,每个家族由多序列比对和隐马尔可夫模型(HMM)表示
- 蛋白质本体:通过明确定义和显示它们之间的关系,对蛋白质相关实体进行本体论表示。
- Treefam公司:动物基因树数据库,包括推断的系统发育树、预测的同源/同源以及基因的进化历史。
- 非重复序列:转录组数据库,提供蛋白质相似性、基因表达、cDNA克隆和基因组位置的信息。
- UniProt公司:蛋白质序列和功能信息资源
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