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DBGET搜索


DBGET公司 链接数据库 KEGG2型

搜索 对于


DBGET公司是主要生物数据库的集成数据库检索系统,分为五类:
类别主要命令备注
bget(bget)b风眨眼
1.DBGET中的KEGG数据库在GenomeNet上镜像
2.其他DBGET数据库
3.网上可搜索数据库用作Web资源
4.Web上的链接数据库
5.PubMed数据库
第三类数据库集成用于关键字搜索,但实际数据将从原始站点获得。第四类数据库仅在LinkDB系统中可用。PubMed是一个链接数据库,但bget页面是使用NCBI服务生成的,以便更好地与KEGG和其他DBGET数据库集成。上描述了DBGET搜索目标本页.


1.DBGET中的KEGG数据库(18+1数据库)

数据库名称 阿伯雷-
航程
内容 备注
凯格 通路 路径 KEGG途径 KEGG通道
英国人 br个 功能层次结构 KEGG BRITE公司
模块 医学博士 KEGG模块 KEGG模块
直系同源 让开 KEGG正畸学 KEGG骨科
基因 生物体 组织
代码
KEGG生物体中的基因 KEGG基因
病毒 vg(vg) 病毒类基因
Vpept公司 副总裁 病毒中的成熟肽
附录 补遗类别中的基因
基因组 荷兰 KEGG生物体和选定病毒 KEGG生物
镁烯   宏基因组中的基因目录 KEGG宏基因组
mgenome公司 毫克纳米 元基因组
配体 复合 cpd公司 化学化合物 KEGG LIGAND公司
聚糖 全球 甘氨酸
反应 尼泊尔 化学反应
rclass类 钢筋混凝土 反应等级
电子商务 酶命名法
网络 网络元素 KEGG网络
变体 hsa变量 人类基因变体
ds公司 人类疾病 KEGG病
药物 博士 药物 KEGG药物
d组 dg公司 药物组
  表达 前任 基因表达谱 作者提交

2.其他DBGET数据库(19个数据库)

数据库名称 阿伯雷-
航程
内容 原始站点
参考序列 再核 rsnt公司 NCBI参考序列数据库 美国国立生物技术信息中心
refpep(参考) 南非共和国
联合保护组织 瑞士保护组织 向上的 服务提供商 UniProt(Universal Protein Resource)蛋白质序列数据库 SIB公司/EBI公司
颤抖 信托收据
refgene公司 rg001型   OM-RGC:海洋微生物参考基因目录 欧洲工商管理学院
rg002型 IGC:人类肠道微生物组综合参考目录 BGI公司/欧洲工商管理学院
rg003型 马图:塔拉海洋海洋地图集Unigenes 塔拉海洋
个人数字广播 个人数字广播 PDB(蛋白质数据库)3D结构数据库 RCSB公司
电子产品开发 电子数据处理 真核启动子 印度科学研究院
主题的 杂岩 蛋白质结构域和家族 ExPASy公司
脉冲幅度调制 功率因数 EBI公司
ncbi-cdd公司 ncbi-cdd公司 美国国立生物技术信息中心
偏振模色散 偏振模色散 蛋白质突变体 DDBJ公司
aa索引 aa索引1 aax1个 氨基酸指数 京都
aa指数2 aax2个
aa索引3 aax3型
pdbstr公司 pdbstr公司 PDB生成的蛋白质序列 京都
碳水化合物组 中央结算系统 碳水化合物结构 Teikyo U公司/
U乔治亚州
检察官 个人数据中心 Prosite文学 ExPASy公司

3.网上可搜索数据库(19个数据库)

数据库名称 阿伯雷-
航程
内容 原始站点
insdc公司 发电机组 国标 国际核苷酸序列数据库合作非冗余数据库 美国国立生物技术信息中心
徽章 刺绣 EBI公司
迪拜联合银行   DDBJ公司
ncbi基因   NCBI Entrez基因数据库 美国国立生物技术信息中心
合奏   真核生物基因组注释数据库 合奏
hgnc公司   人类基因命名法 HGNC公司
brc-dna   RIKEN BRC cDNA克隆文库 里肯BRC
brc-epd公司   植物RIKEN BRC cDNA克隆文库
  基因本体论 GO(开始)
interpro公司   蛋白质结构域和家族 EBI公司
公共化学品   NCBI PubChem(小分子)数据库 美国国立生物技术信息中心
切比   EBI ChEBI(小分子)数据库 EBI公司
pdb-ccd   PDB化学成分词典 偏微分方程
脂质图   脂代谢产物和途径策略 脂肪酶谱
背包   次级代谢产物数据库 KNApSAcK公司
隐马尔可夫数据库   人类代谢组数据库 HMDB公司
3米et   天然代谢物的三维结构 3DMET公司
韧带箱   配体数据库开放且可扩展 配体盒
铁匠   副作用来源 侧面

4.网上链接数据库(93个数据库)

该类别中的数据库可以在中找到链接数据库

5.PubMed数据库

数据库名称 阿伯雷-
缓解
内容 原始站点
公开的 pmid(pmid) 生物医学文献 美国国立生物技术信息中心

上次更新时间:2021年7月7日
反馈 KEGG公司 基因组网 京都大学生物信息中心