欧洲斑马鱼资源中心(EZRC)

关于EZRC

目的

KIT的欧洲斑马鱼资源中心旨在:

  • 为欧洲研究人员的斑马鱼线提供永久性储存库
  • 为欧洲研究人员提供方便且经济高效的斑马鱼线获取途径
  • 为斑马鱼社区提供测序服务
  • 作为全球第一家斑马鱼筛选中心,主机架筛选和化学筛选。

背景

斑马鱼(Danio rerio)和美达卡鱼(Oryzias latipes)是小鱼,它们提供了丰富的遗传、分子和细胞操作工具,这些工具对生物界面项目至关重要。它们的独特特性(体积小、后代众多、胚胎的光学透明性、对遗传和化学筛选的适应性)使其成为在体内鉴定新的关键靶点和控制细胞行为的合成小分子的理想选择。事实上,它们是目前唯一允许筛选对活的完整脊椎动物有机体中的遗传改变或小分子作出反应的表型变化的脊椎动物系统。此外,脊椎动物发育和器官形成背后的干细胞或免疫细胞行为的监测和建模可能具有其他系统无法比拟的分辨率。斑马鱼成体组织的再生能力非常强。肾脏、心脏和大脑等器官再生,功能完全恢复。这使得这些小鱼成为研究成年脊椎动物器官再生的理想系统。15000多个突变体和转基因株系的可用性是生物界面计划和科学界的重要资源。这些鱼类在药物筛选和全动物毒理学研究中引起了越来越多的关注,并为药物筛选提供了新的范例。斑马鱼基因组中70%以上的基因在人类基因组中有相关基因。因此,斑马鱼突变体可以作为许多人类疾病的模型。

设施

KIT拥有欧洲最大的实验鱼类设施,可容纳300000多条鱼,以及在KIT工作的10多个斑马鱼研究小组。因此,进一步扩大设施,作为欧洲斑马鱼资源中心(EZRC)是合乎逻辑的。2012年7月,我们正式开放了EZRC。斑马鱼种群主要以冷冻精子的形式保存。经常需要的品系以及一些野生型菌株也能保持存活。我们已经建立了有效的精子冷冻、解冻管道和数据库。我们在英国欣克斯顿桑格中心Stemple实验室保存了TILLING产生的数千个蛋白质编码基因突变,以及Nsslein-Volhard实验室通过ENU诱变产生的株系,此外还有KIT组产生的或通过合作引入的转基因株系和突变株。我们也接受个人提交的申请,并根据要求将鱼类运送到欧洲和其他地方的PIs。 

该中心不仅维护和分发大量现有的突变和转基因斑马鱼品系,还提供筛选服务和技术,如成像和高通量测序。在与物理学家、工程师和IT专家的密切互动中,我们扩展了KIT最近建立的中/高通量筛选技术。关键领域包括胚胎处理自动化和自动图像采集与处理。我们的平台还涉及开发新的显微镜技术(例如SPIM、DSLM、机器人显微镜),以实现4D的高分辨率实时成像。通过与ComPlat平台相结合,我们还可以支持化学筛选,并为外部用户提供总计多达20000种化合物的库。作为对社区的另一项服务,EZRC向科学社区分发由Helmholtz生物零件库(HeRBi)维护的质粒(cDNA、转基因、Talen、Crispr/Cas9)。

此外,该渔业设施还保留了一系列的溪鱼种群,由卢斯利组。

HeRBi公司

HeRBI(亥姆霍兹生物零件库)是亥姆霍茨合成生物学倡议的一项社区行动(www.helmholtz.de/合成生物学)并提供了一个非盈利存储库,用于存储和分发含有生物零件的质粒,用于合成生物学应用,例如构建复杂的生物设备和系统。

亥姆霍兹合成生物学倡议由德国癌症研究中心的研究人员组成(丹麦自由区)海德堡,亥姆霍兹感染研究中心(HZI公司)德国布伦瑞克环境健康研究中心(HMGU公司)慕尼黑卡尔斯鲁厄理工学院(配套元件),Julich研究中心(福建省),的弗莱堡大学以及海德堡大学.

质粒目前由KIT、FZJ、DKFZ和弗莱堡大学分发。只收取处理和运输费用。