总管氧化还原酶23-FEB-18 6CIC人一氧化氮合酶R354A/G357D突变血红素的标题结构标题2与N-(1-(2-(乙基(甲基)氨基)乙基)-1,2,3,4-的络合物中的结构域标题3四氢喹啉-6-YL)噻吩-2-羰基酰胺压缩机模具ID:1;compnd2分子:一氧化氮合酶,大脑;压缩机3链条:A、B;合成4同义词:构成型NOS、NC-NOS、NOS类型I、神经型NOS和NNOS,合成5肽基半胱氨酸S-亚硝化酶NOS1,BNOS;化合物6 EC:1.14.13.39;压缩机7工程:是;COMPND 8突变:是源MOL_ID:1;来源2 ORGANISM_SCIENTIFIC:HOMO SAPIENS;来源3有机物常见:人类;来源4 ORGANISM_TAXID:9606;来源5器官:脑;来源6基因:NOS1;来源7表达系统:大肠杆菌;来源8 EXPRESSION_SYSTEM_TAXID:469008;来源9 EXPRESSION_SYSTEM_STRAIN:BL21(DE3);来源10 EXPRESSION_SYSTEM_VECTOR_TYPE:血浆;来源11 EXPRESSION_SYSTEM_PLASMID:PCWORIKEYWDS一氧化氮合酶抑制剂复合血红素酶、氧化还原酶EXPDTA X射线衍射作者H.LI,T.L.POULOS修订版5 2013年10月4日6CIC 1链接修订版4 2019年12月4日6CIC 1备注修订版3 2018年11月21日6CIC 1 JRNL修订版2 2018年11月7日6CIC 1 JRNL修订日期:2018年10月31日第6页第0页JRNL AUTH H.LI、R.J.EVENSON、G.CHREIFI、R.B.SILVERMAN、T.L.POULOSJRNL TITL异构选择性一氧化氮合酶的结构基础JRNL TITL 2噻吩-2-酰胺的抑制作用。JRNL参考生物化学V.57 6319 2018JRNL参考ISSN 1520-4995JRNL PMID 30335983JRNL DOI 10.1021/ACS。生物化学8B00895备注2备注2决议。1.75安氏。备注3备注3精炼。备注3计划:PHENIX(1.11.1-2575_1496:???)备注3作者:保罗·亚当斯(PAUL ADAMS)、帕夫尔·阿福宁(PAVEL AFONINE)、陈文森特(VINCENT CHEN)、伊恩(IAN)备注3:DAVIS、KRESHNA GOPAL、RALF GROSSE-KUNSTLEVE、,备注3:LI-WEI HUNG、ROBERT IMMORMINO、TOM IOERGER、,备注3:AIRLIE MCCOY、ERIK MCKEE、NIGEL MORIARTY、,备注3:REETAL PAI、RANDY READ、JANE RICHARDSON、,备注3:大卫·理查德森、托德·罗莫、吉姆·萨切蒂尼、,备注3:NICHOLAS SAUTER、JACOB SMITH、LAURENT备注3:STORONI、TOM TERWILLIGER、PETER ZWART备注3备注3精炼目标:空备注3注释3细化中使用的数据。备注3分辨率范围高(安):1.75备注3分辨率范围低(安):37.92备注3分钟(FOBS/SIGMA_FOBS):0.000备注3范围的完整性(%):97.0备注3反射次数:103944备注3备注3与精炼中使用的数据相匹配。备注3 R值(工作+测试集):0.174备注3 R值(工作集):0.172备注3自由R值:0.204备注3自由R值测试集大小(%):4.880备注3自由R值测试集计数:9735备注3备注3:符合炼油厂使用的数据(在箱子中)。备注3箱子分辨率范围复杂。NWORK NFREE RWORK RFREE公司备注3 1 37.9303-5.4376 1.00 6552 296 0.1478 0.1646备注3 2 5.4376-4.3180 1.00 6481 330 0.1237 0.1530备注3 3 4.3180-3.7727 1.00 6520 339 0.1257 0.1609备注3 4 3.7727-3.4280 1.00 6478 359 0.1322 0.1672备注3 5 3.4280-3.1825 1.00 6535 341 0.1458 0.1860备注3 6 3.1825-2.9949 0.99 6498 307 0.1621 0.1872备注3 7 2.9949-2.8450 0.99 6468 326 0.1610 0.1907备注3 8 2.8450-2.7212 0.99 6509 285 0.1765 0.2017备注3 9 2.7212-2.6164 0.99 6413 367 0.1770 0.2251备注3 10 2.6164-2.5262 0.99 6521 318 0.1770 0.2277备注3 11 2.5262-2.4472 0.99 6394 366 0.1778 0.2062备注3 12 2.4472-2.3772 0.98 6293 347 0.1873 0.1989备注3 13 2.3772-2.3147 0.98 6484 357 0.1955 0.2349备注3 14 2.3147-2.2582 0.98 6357 303 0.1995 0.2504备注3 15 2.2582-2.2069 0.98 6457 320 0.2036 0.2159备注3 16 2.2069-2.1599 0.98 6384 318 0.2138 0.2581备注3 17 2.1599-2.1167 0.98 6314 333 0.2226 0.2543备注3 18 2.1167-2.0768 0.98 6349 338 0.2348 0.3001备注3 19 2.0768-2.0397 0.97 6338 336 0.2461 0.2972备注3 20 2.0397-2.0051 0.96 6262 297 0.2579 0.3044备注3 21 2.0051-1.9728 0.96 6224 383 0.2732 0.2898备注3 22 1.9728-1.9424 0.95 6113 322 0.2874 0.3074备注3 23 1.9424-1.9139 0.95 6287 271 0.3051 0.3549备注3 24 1.9139-1.8869 0.95 6207 331 0.3242 0.3773备注3 25 1.8869-1.8614 0.95 6156 353 0.3363 0.3375备注3 26 1.8614-1.8372 0.95 6202 321 0.3391 0.3877备注3 27 1.8372-1.8143 0.95 6113 331 0.3330 0.3479备注3 28 1.8143-1.7924 0.93 6126 280 0.3445 0.3852备注3 29 1.7924-1.7716 0.94 6101 312 0.3602 0.3880备注3 30 1.7716-1.7517 0.84 5508 248 0.3890 0.4335备注3备注3散装溶剂建模。备注3使用的方法:空备注3溶剂半径:1.11备注3收缩半径:0.90备注3 K_SOL:NULL备注3 B_SOL:空备注3备注3错误估计。备注3坐标误差(基于最大似然):0.210备注3相位误差(基于最大似然度):28.180备注3记下3 B值。威尔逊地块备注3(A**2):空备注3平均B值(总体,A**2):空备注3总体各向异性B值。备注3 B11(A**2):空备注3 B22(A**2):空备注3 B33(A**2):空备注3 B12(A**2):空备注3 B13(A**2):空备注3 B23(A**2):空备注3备注3双胞胎信息。备注3分数:空备注3运算符:空备注3记下与理想值的3个偏差。备注3 RMSD计数备注3债券:0.006 7284备注3角度:0.993 9916备注3手性:0.052 1020备注3平面度:0.005 1260备注3 DIHEDRAL:17.367 4269备注3备注3 TLS详细信息备注3 TLS组数量:2备注3 TLS组:1备注3选择:(链A和树脂302:722)备注3组来源(A):117.4141 249.6593 361.1207备注3 T张力备注3 T11:0.1653 T22:0.2217备注3 T33:0.2110 T12:-0.0258备注3 T13:0.0300 T23:0.0285备注3 L张力备注3 L11:0.8312 L22:0.8666备注3 L33:2.0684 L12:-0.1651备注3 L13:0.0610 L23:0.2794备注3张力备注3 S11:0.0002 S12:-0.0419 S13:0.0363备注3 S21:-0.0225 S22:-0.0412 S23:-0.0380备注3 S31:0.0343 S32:0.1262 S33:0.0383备注3 TLS组:2备注3选择:(链B和树脂304:722)备注3组(A)的来源:115.6837 248.4107 323.7108备注3 T张力备注3 T11:0.2566 T22:0.3195备注3 T33:0.2811 T12:0.0148备注3 T13:0.0295 T23:-0.0208备注3 L张力备注3 L11:0.7683 L22:0.8513备注3 L33:3.2622 L12:-0.1440备注3 L13:-0.1211 L23:0.0360备注3张力备注3 S11:0.0494 S12:0.1038 S13:0.0317备注3 S21:-0.0845 S22:-0.0589 S23:0.0734备注3 S31:-0.0845 S32:-0.1733 S33:0.0052备注3备注3 NCS细节备注3 NCS组数:空备注3备注3其他精炼备注:空备注4备注4 6CIC符合格式V.3.30,2011年7月13日备注100备注100本条目已由RCSB于2018年2月26日处理。备注100存款ID为D_1000232678。备注200备注200实验细节备注200实验类型:X射线衍射备注200数据收集日期:2017年3月18日备注200温度(开尔文):100备注200 PH:7.2备注200使用的晶体数量:1备注200备注200同步器(是/否):是备注200辐射源:SSRL备注200梁线:BL12-2备注200 X射线发生器型号:空备注200单色或LAUE(M/L):M备注200波长或范围(A):1.0332备注200单色仪:石墨备注200光学:反射镜备注200备注200探测器类型:像素备注200探测器制造商:DECTRIS PILATUS 6M备注200强度集成软件:XDS备注200数据缩放软件:无人机备注200备注200独特反射次数:106791备注200分辨率范围高(A):1.750备注200分辨率范围低(A):60.000备注200拒绝标准(SIGMA(I)):-3.000备注200总体评论200。备注200范围的完整性(%):99.6备注200数据冗余:8.800备注200合并(I):0.12100备注200 R SYM(I):0.12100备注200对于数据集:8.2000备注200在最高分辨率外壳中备注200。备注200最高分辨率外壳,范围高(A):1.75备注200最高分辨率外壳,范围低(A):1.80备注200壳体完整性(%):93.3在外壳中备注200数据冗余:7.90备注200 R合并SHELL(I):5.05400壳体(I)备注200 R SYM:5.05400备注200壳体:0.400备注200备注200衍射协议:单波长备注200用于确定结构的方法:福利尔合成备注200使用的软件:REFMAC备注200启动型号:4UH5备注200备注200备注:板材备注280备注280晶体备注280溶剂含量,VS(%):55.20备注280马修斯系数,VM(安氏**3/DA):2.74备注280备注280结晶条件:8%PEG3350 35MM柠檬酸65MM BIS备注280-三丙烷10%甘油5MM TCEP,PH7.2,蒸汽扩散,备注280落座,温度277K备注290备注290晶体对称性备注290空间群的对称算子:P 21 21 21备注290备注290对称性备注290 NNNMMM操作员备注290 1555 X、Y、Z备注290 2555-X+1/2,-Y,Z+1/2备注290 3555-X,Y+1/2,-Z+1/2备注290 4555 X+1/2,-Y+1/2,-Z备注290备注290,其中NNN->操作员编号备注290 MMM->翻译向量备注290备注290晶体对称变换备注290以下变换作用于原子/混合体在本条目中备注290条记录,以制作结晶备注290个相关分子。备注290 SMTRY1 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.00000 0.00000备注290平方米2 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.00000备注290 SMTRY3 1 0.000000 0.000000 1.000000 0.00000备注290 SMTRY1 2-1.00000000.000000 0.000000 26.15900备注290 SMTRY2 2 0.000000-1.000000.000000 0.00000备注290 SMTRY3 2 0.000000 0.000000 1.00000082.56550备注290 SMTRY1 3-1.00000000.000000 0.000000 0.00000备注290 SMTRY2 3 0.000000 1.000000 0.000000 61.07850备注290 SMTRY3 3 0.000000 0.000000-1.000000 82.56550备注290 SMTRY14 1.0000000.000000 0.000000 26.15900备注290 SMTRY2 4 0.000000-1.000000.000000 61.07850备注290 SMTRY3 4 0.000000 0.000000-1.000000 0.00000备注290备注290备注:空备注300备注300生物分子:1备注300有关作者提供的和/或程序,请参阅备注350备注300中生成的结构装配信息备注300此条目。备注还可能提供有关备注300埋地面积。备注350记下代表已知的完整乘数的350个坐标备注350生物意义上的齐聚状态备注350应用生物转化可以生成分子记住下面给出的350。非晶态和备注350给出了晶体学操作。备注350备注350生物分子:1备注350作者确定的生物单位:DIMERIC备注350软件确定的四元结构:DIMERIC备注350使用的软件:PISA备注350总埋地面积:9820安**2备注复合体的350表面积:33770安**2备注350无溶剂能量变化:-86.0 KCAL/MOL备注350将以下内容应用于链条:A、B备注350生物1 1.0000000.000000 0.000000 0.00000 0.00000备注350 BIOMT2 1 0.000000 1.000000 0.000000 0.00000备注350 BIOMT3 1 0.000000 0.000000 1.000000 0.00000备注465备注465缺失残留物备注465以下残留物不在备注465实验。(M=型号;RES=剩余名称;C=链条备注465标识符;SSSEQ=序列号;I=插入代码。)备注465备注465 M RES C SSSEQI备注465 CYS B 302备注465 PRO B 303备注500评论500几何学和立体化学备注500子主题:同一非对称单元中的紧密接触备注500备注500以下原子紧密接触。备注500备注500 ATM1 RES C SSEQI ATM2 RES S C SSEQUI距离备注500 O HOH A 1194 O HOH A1346 2.17备注500备注500备注:空备注500评论500几何学和立体化学备注500主题:扭转角备注500在预期的拉马钱德兰区域外标注500个扭转角:备注500(M=型号;RES=剩余名称;C=链标识符;备注500 SSEQ=序列号;I=插入代码)。备注500备注500标准表:备注500格式:(10X,I3,1X,A3,1X,A1,I4,A1,4X,F7.2,3X,F7.2)备注500备注500个预期值:GJ KLEYWEGT和TA JONES(1996)。PHI/PSI-记下500首合唱:拉马钱德朗重温。结构4,1395-1400备注500备注500 M RES CSSEQI PSI PHI备注500 PRO A 350-73.09-84.49备注500 GLU A 351-32.37-38.79备注500 VAL A 353 175.51 49.65注释500 THR A 471-89.88-111.70备注500 CYS A 587 58.75-152.41备注500 ARG A 608-132.98-117.26备注500 PRO B 350 1.75-69.49备注500 ASP B 352 39.44-93.14注释500 THR B 471-82.18-108.45备注500 CYS B 587 59.77-150.77备注500 ARG B 608-134.60-113.30备注500备注500备注:空备注525备注525溶剂备注525备注525溶剂分子的链标识符备注525表示聚合物链,其中聚合物链最多备注525密切相关。备注列出了所有溶剂请记住525个分子,它们与备注525最近的聚合物链(M=型号;备注525 RES=剩余名称;C=链标识符;SSEQ=序列备注525编号;I=插入代码):备注525备注525 M RES CSSEGI备注525如何A1350距离=6.25安备注620备注620金属协调备注620(M=型号;RES=剩余名称;C=链标识符;备注620 SSEQ=序列号;I=插入代码):备注620备注:M RES CSSEGI金属620协调角备注620 ZN A 805 ZN备注620 N RES CSSEQI原子备注620 1 CYS A 331 SG备注620 2 CYS A 336 SG 113.1备注620 3 CYS B 331 SG 122.4 102.6备注620 4 CYS B 336 SG 101.8 100.8 114.4备注620 N 1 2 3备注620备注:M RES CSSEGI金属620协调角备注620下摆A 801 FE备注620 N RES CSSEQI原子备注620 1 CYS A 420 SG备注620 2 HEM A 801 NA 99.3备注620 3下摆A 801 NB 100.3 86.6备注620 4 HEM A 801 NC 101.8 158.9 88.9备注620 5 HEM A 801 ND 103.6 88.6 156.0 87.2备注620 N 1 2 3 4备注620备注:M RES CSSEGI金属620协调角备注620 HEM B 801 FE备注620 N RES CSSEQI原子备注620 1 CYS B 420 SG备注620 2 HEM B 801 NA 96.6备注620 3下摆B 801 NB 97.9 85.4备注620 4折边B 801 NC 101.0 162.2 90.0备注620 5 HEM B 801 ND 102.6 90.7 159.5 87.6备注620 N 1 2 3 4备注800备注800站点备注800站点标识符:AC1备注800证据_代码:软件备注800位置_描述:残余HEM A 801的结合位置备注800备注800站点标识符:AC2备注800证据_代码:软件备注800位点_描述:残基H4B A 802的结合位点备注800备注800站点标识符:AC3备注800证据_代码:软件备注800位置_描述:残余物7R2 A 803的结合位置备注800备注800站点标识符:AC4备注800证据_代码:软件备注800位点_描述:残基GOL A 804的结合位点备注800备注800站点标识符:AC5备注800证据_代码:软件备注800位置_描述:残留ZN A 805的结合位置备注800备注800站点标识符:AC6备注800证据_代码:软件备注800位置_描述:残余HEM B 801的结合位置备注800备注800站点标识符:AC7备注800证据_代码:软件备注800位置_描述:残基H4B B 802的结合位置备注800备注800站点标识符:AC8备注800证据_代码:软件备注800位置_描述:残余物7R2 B 803的结合位置备注800备注800站点标识符:AC9备注800证据代码:软件备注800位点_描述:残基GOL B 804的结合位点备注900备注900个相关条目备注900相关ID:6CIC相关DB:PDBDBREF 6CIC A 302 722 UNP P29475 NOS1_HUMAN 302 721号文件DBREF 6CIC B 302 722 UNP P29475 NOS1_HUMAN 302 721号文件SEQADV 6CIC ALA A 354 UNP P29475 ARG 354基因工程突变SEQADV 6CIC ASP A 357 UNP P29475 GLY 357基因工程突变SEQADV 6CIC ALA B 354 UNP P29475 ARG 354基因工程突变SEQADV 6CIC ASP B 357 UNP P29475 GLY 357基因工程突变序列1 A 421 CYS PRO ARG PHE LEU LYS VAL LYS ASN TRP GLU THR GLU序列2 A 421 VAL LEU THR ASP THR LEU HIS LEU LYS SER THR LEU序列3 A 421 GLU THR GLY CYS THR GLU TYR ILE CYS MET GLY SER ILE序列4 A 421遇到了HIS PRO SER GLN HIS ALA ARG ARG PRO GLU ASP VAL序列5 A 421 ALA THR LYS ASP GLN LEU PHE PRO LEU ALA LYS GLU PHE序列6 A 421 ILE ASP GLN TYR TYR SER ILE LYS ARG PHE GLY SER序列7 421 LYS ALA HIS MET GLU ARG LEU GLU VAL ASN LYS GLU序列8 A 421 ILE ASP THR SER THR TYR GLN LEU LYS ASP TH GLU序列9 421 LEU ILE TYR GLY ALA LYS HIS ALA TRP ARG ASN ALA SER序列10 A 421 ARG CYS VAL GLY ARG ILE GLN TRP SER LYS LEU GLN VAL序列11 A 421 PHE ASP ALA ARG ASP CYS THR ALA HIS GLY MET PHE第12集421名ASN TYR ILE CYS ASN HIS VAL LYS TYR ALA THR ASN LYS序列13 A 421 GLY ASN LEU ARG SER ALA ILE THRILE PHE PRO GLN ARG序列14 A 421 THR ASP GLY LYS HIS ASP PHE ARG VAL TRP ASN SER GLN序列15 A 421 LEU ILE ARG TYR ALA GLY TYR LYS GLN PRO ASP GLY SER序列16 A 421 THR LEU GLY ASP PRO ALA ASN VAL GLN PHE THR GLU ILE序列17 A 421 CYS ILE GLN GLN GLY TRP LYS PRO ARG GLY ARG PHE序列18 A 421 ASP VAL LEU PRO LEU LEU GLN ALA ASN GLY ASN ASP序列19 A 421 PRO GLU LEU PHE GLN ILE PRO GLU LEU VAL LEU GLU序列20 A 421 VAL PRO ILE ARG HIS PRO LYS PHE GLU TRP PHE LYS ASP序列21 A 421 LEU GLY LEU LYS TRP TYR GLY LEO PRO ALA VAL SER ASN序列22 A 421 MET LEU LEU GLU ILE GLY GLY LEU PHE SER ALA CYS序列23 A 421 PRO PHE SER GLY TRP TYR MET GLY THR GLU ILE GLY VAL序列24 A 421 ARG ASP TYR CYS ASP ASN SER ARG TYR ASN ILE LEU GLU序列25 A 421 GLU VAL ALA LYS LYS MET ASN LEU ASP MET ARG LYS THR序列26 A 421 SER SER LEU TRP LYS ASP GLN ALA LEU VAL GLU ILE ASN序列27 A 421 ILE ALA VAL LEU TYR SER PHE GLN SER ASP 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