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UCSF Chimera参考

主要参考:
UCSF Chimera——用于探索性研究和分析的可视化系统。Pettersen EF、Goddard TD、Huang CC、Couch GS、Greenblatt DM、Meng EC、Ferrin TE。计算机化学杂志。2004年10月;25(13):1605-12.

关于特征和方法的其他论文:

多域汇编程序(MDA)生成大的多域蛋白质模型。Hertig S、Goddard TD、Johnson GT、Ferrin TE。生物物理学杂志。2015年5月5日;108(9):2097-102.
RRDistMaps:UCSF Chimera工具用于查看和比较蛋白质距离图。Chen JE,Huang CC,Ferrin TE。生物信息学。2015年5月1日;31(9):1484-6。
通过web服务增强UCSF Chimera。Huang CC、Meng EC、Morris JH、Pettersen EF、Ferrin TE。核酸研究。2014年7月;42(Web服务器问题):W478-84。
UCSF Chimera、MODELLER和IMP:集成建模系统。Yang Z、Lasker K、Schneidman-Duhovny D、Webb B、Huang CC、Pettersen EF、GoddardTD、Meng EC、Sali A、Ferrin TE。结构生物学杂志。2012年9月;179(3):269-78.
基于分水岭和尺度空间滤波,以及通过对齐区域来拟合结构。Pintile GD、Zhang J、Goddard TD、Chiu W、Gossard DC。结构生物学杂志。2010年6月;170(3):427-38.
structureViz:连接Cytoscape和UCSF Chimera。Morris JH、Huang CC、Babbitt PC、Ferrin TE。生物信息学。2007年9月1日;23(17):2345-7.
使用UCSF Chimera可视化密度图。Goddard TD、Huang CC、Ferrin TE。结构生物学杂志。2007年1月;157(1):281-7.
使用UCSF Chimera进行集成序列结构分析的工具。Meng EC、Pettersen EF、Couch GS、Huang CC、Ferrin TE。BMC生物信息学。2006年7月12日;7:339.
UCSF Chimera的核酸可视化。Couch GS、Hendrix DK、Ferrin TE。核酸研究。2006年2月14日;34(4):e29。
UCSF chimera的软件扩展,用于交互式可视化大分子组装。Goddard TD、Huang CC、Ferrin TE。结构。2005年3月;13(3):473-82.