老虎扫描

通知

TIGR扫描现在被一种名为

可从以下地址获得www.genezilla.org.全部TIGRscan的开发工作已转移到新项目上，它将保持开源，并可从上面免费下载URL。预计该计划将在不久的将来。

关于TigrScan

TigrScan是一种基于广义隐马尔可夫模型框架，类似于Genscan和精灵。它具有高度可重构性，并包括用于再培训的软件。它是用高度优化的C++编写。运行时和内存要求在序列长度上是线性的。的图论表示提供了高得分开放式阅读框，允许探索次优基因模型。

它使用插值马尔可夫模型（IMM）。

执行速度：大约12 Kb/sec3.2 GHz Pentium IV（处理人类基因组的时间不到3天）。
内存要求：一般情况下，对于400Kb序列。

下载

TigrScan可用于下载作为现场视察认证开源软件在艺术许可证. 经过预训练的模型文件也可用。

文件		描述

老虎扫描.tar.gz		完整的源代码

老虎抗狂犬病.tar.gz		的模型文件拟南芥

tigrscan-tetrahymena.tar.gz老虎		的模型文件嗜热四膜虫（经过培训在恶性疟原虫和长时间四膜虫ORF）

tigrscan塑性.tar.gz		的模型文件恶性疟原虫

tigrscan到xoplama.tar.gz		的模型文件弓形虫

虎尾蛇.tar.gz		的模型文件烟曲霉