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流排序。脐血组合450k

Illumina 450k/EPIC关于FACS和MACS脐血细胞的数据


生物导体版本:释放(3.18)

用于估计minfi和类似软件包中脐血细胞比例的原始数据对象。FlowSorted。CordBloodCombined450k对象基于Bakulski等人、Gervin等人、de Goede等人和Lin等人分析的样本。

作者:卢卡斯·A·萨拉斯[cre,aut],克里斯蒂娜·格尔文[aut]、米根·C·琼斯[aut',凯利·M·巴考斯基[ctb],戴文·科斯特勒[ctb',约翰·K·威奇[ctb]],卡尔·T·凯尔西[ctb],罗伯特·莱尔[ctb4],布罗克·克里斯滕森[ctb〕,珍妮·费利克斯[ctb】

维护人员:卢卡斯·萨拉斯(Lucas A.Salas)<Lucas.A.Salas.diaz at dartmouth.edu>

引文(从R中输入引文(“FlowSorted.CordBloodCombined.450k”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.3”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::安装(“FlowSorted.CordBloodCombined.450k”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览渐晕图(“FlowSorted.CordBloodCombined.450k”)
流排序。脐血组合450k HTML格式 R脚本
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新闻 文本

细节

生物视图 实验数据,实验中心,基因组,人乳头数据,甲基化阵列数据,微阵列数据,组织,组织微阵列数据
版本 1.18.0
许可证 GPL-3公司
取决于 R(>=3.6),米菲(>= 1.21.2),实验中心(>= 1.9.1)
进口 总结性实验,IlluminaHumanMethylation450kanno.ilmn12.hg19公司(>= 0.2.1),Illumina人甲基化EPICanno.ilm10b4.hg19,实用程序,批注中心
系统要求
统一资源定位地址 https://github.com/immunomethylomics/FlowSorted.CordBloodCombined.450k
错误报告 https://github.com/immunomethylomics/FlowSorted.CordBloodCombined.450k/issues。
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建议 流排序。鲜血。EPIC公司knitr rmarkdown测试,IlluminaHumanMethylation450k最佳(>=0.2.0),Illumina人甲基化EPICanno.ilm10b2.hg19
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程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 流排序。脐血组合450k_1.18.0.tar.gz
Windows二进制
macOS二进制(x86_64)
macOS二进制(arm64)
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/FlowSorted.CordBloodCombined.450k
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/FlowSorted。脐血组合450k
包短Url https://bioconductor.org/packages/FlowSorted.CordBloodCombined.450k/
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