###来自vignette源‘pvca’的R代码。Rnw'(右)######################################################代码块编号1:安装(eval=FALSE)#####################################################if(!requireNamespace(“生物管理器”,悄悄=真))##install.packages(“BiocManager”)##BiocManager::安装(“pvca”)######################################################代码块编号2:示例###################################################图书馆(golubEsets)库(pvca)数据(Golub_Merge)pct阈值<-0.6批次系数<-c(“ALL.AML”,“BM.PB”,“来源”)pvcaObj<-pvcaBatchAssess(Golub_Merge,batch.factors,pct_threshold)######################################################代码块编号3:绘图(eval=FALSE)#####################################################bp<-barplot(pvcaObj$dat,xlab=“效果”,##ylab=“加权平均比例方差”,##ylim=c(0,1.1),col=c(“蓝色”),las=2,##main=“PVCA估算条形图”)##轴(1,at=bp,labels=pvcaObj$label,xlab=“效果”,cex.axis=0.5,las=2)##值=pvcaObj$dat##new_values=圆形(值,3)##文本(bp,pvcaObj$dat,labels=new_values,pos=3,cex=0.8)## ######################################################代码块编号4:<###################################################打印(sessionInfo())