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加权蛋白质-蛋白质相互作用

生物导体版本：释放（3.18）

蛋白质相互作用数据对于组学数据分析和建模至关重要。数据库知识是通用的，而不是特定于细胞类型、生理条件或任何其他上下文，这些上下文决定了哪些连接是功能性的，哪些连接有助于信号传递。基因本体论和人类表型本体论等功能注释可能有助于评估交互的相关性。该软件包基于功能注释（如人类蛋白质本体论和基因本体论）预测蛋白质相互作用的功能相关性，并基于网络拓扑、功能评分和路径搜索算法对基因进行优先级排序。

作者：安娜·加尔霍兹[cre，aut]，Denes Turei[奥特]，Michael P.Menden[作者]，Albert Krewinkel[ctb，cph]（pagebreak Lua过滤器）

维护人员：Ana Galhoz<helmholtz-muenchen.de>的Ana.Galhoz

引文（从R中输入引文（“wppi”）):

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“4.3”）并输入：

如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：安装（“wppi”）

对于旧版本的R，请参阅相应的生物导体释放.

文件

要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：

浏览幻影（“wppi”）

WPPI工作流	HTML格式	R脚本
参考手册	PDF格式
新闻	文本
许可证	文本

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细节

生物视图	注释,基因信号,基因目标,图形和网络,网络,路径,软件,系统生物学,转录组学
版本	1.10.0
在生物导体中	生物化学3.13（R-4.1）（3年）
许可证	MIT+文件许可证
取决于	R（>=4.1）
进口	dplyr、igraph、logger、methods、magrittr、Matrix、，全能运动员（>=2.99.8），进度，purrr，rlang，RCurl，stats，tibble，tidyr
系统要求
统一资源定位地址	https://github.com/AnaGalhoz37/wppi
错误报告	https://github.com/AnaGalhoz37/wppi/issues网站

建议	knitr、test、rmarkdown
链接到
增强功能
取决于我
导入我
建议我
指向我的链接
生成报告	生成报告

程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包	wppi_1.10.0.tar.gz号
Windows二进制	wppi_1.10.0.zip文件
macOS二进制（x86_64）	wppi_1.10.0.tgz型
macOS二进制（arm64）	wppi_1.10.0.tgz
源码库信息	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/wppi
源存储库（开发人员访问）	git克隆git@git.bioconductor.org：包/wppi
Bioc软件包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/wppi/
包短Url	https://bioconductor.org/packages/wppi/
软件包下载报告	下载统计信息