过渡

RNA结合蛋白基序分析

生物导体版本：释放（3.18）

transite是一种计算方法，通过利用现有的基因表达数据和RNA结合蛋白结合偏好的现有知识，可以全面分析RNA结合蛋白在各种细胞过程中的调节作用。

作者：康斯坦丁·克里斯默[aut，cre，cph]，安娜·加廷格[aut]，迈克尔·亚菲[ths，cph]，伊恩·坎内尔

维护人员：Konstantin Krismer＜麻省理工学院的Krismer＞

引文（从R中输入引文（“transite”）):

要安装此软件包，请启动R（版本“4.3”）并输入：

如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.软件包（“BiocManager”）BiocManager:：安装（“传输”）

对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.

要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：

浏览幻影（“过渡”）

生物视图	微分表达式,基因表达式,GeneSet扩展,遗传学,微阵列,软件,转录,mRNA微阵列
版本	1.20.1
在生物导体中	生物技术3.8（R-3.5）（5.5年）
许可证	MIT+文件许可证
取决于	R（>=3.5）
进口	生物遗传学(>= 0.26.0),生物串（>=2.48.0），dplyr（>=0.7.6），基因组学范围（>=1.32.6），ggplot2（>=3.0.0），grDevices，gridExtra（>=2.3），methods，parallel，Rcpp（>=1.0.4.8），scales（>=10.0.0），stats，TFMP值（>=0.0.8），utils
系统要求	C++11
统一资源定位地址	网址：https://transite.mit.edu

建议	knitr（>=1.20），rmarkdown（>=1.10），oxygen2（>=6.1.0），test that（>=2.1.0）
链接到	Rcpp（>=1.0.4.8）
增强功能
取决于我
导入我
建议我
指向我的链接
生成报告	生成报告

跟随安装在您的R会话中使用此软件包的说明。

源程序包	传输_1.20.1.tar.gz
Windows二进制	transite_1.20.1.zip公司
macOS二进制（x86_64）	传输_1.20.1.tgz
macOS二进制（arm64）	传输_1.20.1.tgz
源码库信息	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/transite网站
源存储库（开发人员访问）	git克隆git@git.bioconductor.org：包裹/转运
Bioc软件包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/transite网站/
包短Url	https://bioconductor.org/packages/transite网站/
软件包下载报告	下载统计信息
BioC 3.18的旧源程序包	源存档