简单丰富

简化函数丰富结果

生物导体版本：释放（3.18）

该软件包实现了一种新的聚类算法“二元切割”，用于聚类函数项的相似矩阵。它还提供了可视化、总结和比较聚类的功能。

作者：祖光顾[aut，cre]

维护人员：祖光顾<z.Gu at dkfz.de>

引文（从R中输入引文（“simplifyEnrichment”）):

要安装此软件包，请启动R（版本“4.3”）并输入：

如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.软件包（“BiocManager”）BiocManager:：install（“simplifyEnrichment”）

对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.

要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：

浏览幻影（“simplifyEnrichment”）

生物视图	群集,去,GeneSet扩展,软件,可视化
版本	1.12.0
在生物导体中	生物柴油3.12（R-4.0）（3.5年）
许可证	MIT+文件许可证
取决于	R（>=3.6.0），生物遗传学，网格
进口	GOSemSim公司,复杂热图（>=2.7.4），循环，GetoptLong，digest，tm，政府.db,组织Hs.eg.db,注释Dbi，slam，methods，线索，grDevices，graphics，stats，utils，proxyC，Matrix，cluster（>=1.14.2），colorspace，全局选项（>=0.1.0）
系统要求
统一资源定位地址	https://github.com/jokergoo/simplifyEnrichment网站 https://simplifyEnrichment.github.io网站

建议	knitr、ggplot2、cowplot、mclust、apcluster、MCL、dbscan、igraph、gridExtra、dynamicTreeCut、testtat、gridGraphics、，clusterProfiler（群集探查器），msigdbr，剂量,出生日期.db,反应.db、flexclust、Bioc经理、，交互式复杂热图（>=0.99.11），有光泽，闪亮的仪表板，可乐,胡6800.db、rmarkdown、，基因过滤器，网格文本，fpc
链接到
增强功能
取决于我
导入我
建议我	可乐,交互式复杂热图,帕雷格,西蒙娜
链接到我
生成报告	生成报告

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包	simplifyEnrichment_1.12.0.tar.gz
Windows二进制	simplifyEnrichment_1.12.0.zip
macOS二进制（x86_64）	简单丰富_1.12.0.tgz
macOS二进制（arm64）	简单丰富_1.12.0.tgz
源码库信息	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/simplifyEnrichment网站
源存储库（开发人员访问）	git克隆git@git.bioconductor.org：packages/simplifyEnrichment
Bioc软件包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/simplifyEnrichment网站/
包短Url	https://bioconductor.org/packages/simplifyEnrichment网站/
软件包下载报告	下载统计信息