omicplotR公司
使用闪亮的应用程序可视化探索Omic数据集
生物导体版本：释放（3.18）
一个闪亮的应用程序，用于将组学数据集作为组成进行可视化探索，并使用ALDEx2进行差异丰度分析。有助于探索RNA-seq、meta-RNA-seq16s rRNA基因测序和可视化，如主成分分析双位图（使用元数据着色以可视化每个变量）、树状图和堆叠条形图以及效果图（ALDEx2）。输入是计数表和元数据文件（如果存在元数据），可以选择按计数或按元数据筛选数据以删除低计数，或者根据选定的元数据可视化选择样本。
作者：Daniel Giguere[aut，cre]，Jean Macklaim[aut]，Greg Gloor[aut]
维护人员：丹尼尔·吉奎尔（Daniel Giguere）
引文（从R中输入引文（“omicplotR”）):
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“4.3”）并输入：
如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.软件包（“BiocManager”）BiocManager:：安装（“omicplotR”）
对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.
文档
要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：
浏览幻影（“omicplotR”）
细节
| 生物视图 |
贝叶斯主义者,DNASeq公司,微分表达式,图形用户界面,基因表达,免疫肿瘤学,基因组,微生物组,RNA序列,排序,软件,转录组学,可视化 |
| 版本 |
1.22.0 |
| 在生物导体中 |
生物技术3.7（R-3.5）（6年） |
| 许可证 |
MIT+文件许可证 |
| 取决于 |
R（>=3.6），ALDEx2型(>= 1.18.0) |
| 进口 |
合成、DT、grDevices、knitr、jsonlite、matrixStats、rmarkdown、shirn、stats、vegan、zCompositions |
| 系统要求 |
|
| 统一资源定位地址 |
|
查看更多
| 建议 |
|
| 链接到 |
|
| 增强功能 |
|
| 取决于我 |
|
| 导入我 |
|
| 建议我 |
|
| 指向我的链接 |
|
| 生成报告 |
生成报告 |
程序包档案
跟随安装在您的R会话中使用此软件包的说明。
