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多MiR

多个microRNA-目标数据库与其疾病和药物相关性的集成


生物导体版本:释放(3.18)

来自外部资源的微小RNA/靶标的集合,包括经验证的微小RNA靶标数据库(miRecords、miRTarBase和TarBase)、预测的微小RNA靶标数据库(DIANA-microT、ElMMo、MicroCosm、miRanda、miRDB、PicTar、PITA和TargetScan)和微小RNA疾病/药物数据库(miR2Disease、Pharmaco-miR-VerSe和PhenomiR)。

作者:Ru Yuanbin[aut]、Matt Mulvahill[cre,aut],Spencer Mahaffey[aut]、Katerina Kechris[aut,cph,ths]

维护人员:马特·穆尔瓦希尔(Matt Mulvahill)

引文(从R中输入引文(“multiMiR”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.3”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::安装(“multiMiR”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览Vignette(“multiMiR”)
multiMiR用户指南 HTML格式 R脚本
参考手册 PDF格式
许可证 文本

细节

生物视图 人乳头数据,Mus_肌肉_数据,组织数据,Rattus_norvegicus_Data(鼠类_蔬菜_数据),软件,miRNA数据
版本 1.24.0
在生物导体中 生物技术3.6(R-3.4)(6.5年)
许可证 MIT+文件许可证
取决于 R(>=3.4)
进口 统计、XML、RCurl、purrr(>=0.2.2)、tible(>=1.2)、方法、,生物遗传学,注释Dbi,dplyr
系统要求
统一资源定位地址 https://github.com/KechrisLab/multiMiR网站
错误报告 https://github.com/KechrisLab/multiMiR/issues网站
查看更多
建议 仿生风格,边缘R、knitr、rmarkdown、testhat(>=1.0.2)
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程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 多重MiR_1.24.0.tar.gz
Windows二进制 multiMiR_1.24.0.zip
macOS二进制(x86_64) 多重MiR_1.24.0.tgz
macOS二进制(arm64) 多重MiR_1.24.0.tgz
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/multiMiR
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:软件包/multiMiR
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/multiMiR网站/
包短Url https://bioconductor.org/packages/multiMiR网站/
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