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弥赛纳

两组生存问题差异表达的单基因分类器和抗离群检测


生物导体版本:释放(3.18)

Messina是一个算法集合,用于构建最稳健的单基因分类器,以及在存在离群值或未知样本子组的情况下识别差异表达。这些方法可用于识别潜在特征以发展为临床测试(诊断和预后),以及在部分样本显示异常表达模式时识别差异表达。

作者:Mark Pinese[aut]、Mark Pines[cre]、Mark-Pinese[cph]

维护人员:马克·皮内塞(Mark Pinese)<mpinese at ccia.org.au>

引文(从R中输入引文(“墨西拿”))以下为:

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.3”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::install(“messina”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览幻影(“墨西拿”)
使用墨西拿 PDF格式 R脚本
参考手册 PDF格式
新闻 文本

细节

生物视图 生物医学信息学,分类,微分表达式,基因表达式,软件,生存
版本 1.38.0
在生物导体中 生物技术2.14(R-3.1)(10年)
许可证 EPL(>=1.0)
取决于 R(>=3.1.0),生存率(>=2.37-4),方法
进口 Rcpp(>=0.11.1),plyr(>=1.8),ggplot2(>=0.9.3.1),网格(>=3.1.0),foreach(>=1.4.1),图形
系统要求
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建议 knitr(>=1.5),反配置文件数据(>= 0.99.2),博科生物(>= 2.22.0),仿生风格
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增强功能 doMC(>=1.3.3)
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程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 消息_1.38.0.tar.gz
Windows二进制 messina_1.38.0.zip
macOS二进制(x86_64) messina_1.38.0.tgz
macOS二进制(arm64) messina_1.38.0.tgz
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/messina网站
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:套餐/messina
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/messina网址/
包短Url https://bioconductor.org/packages/messina网站/
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