mCSEA公司

甲基化CpGs集富集分析

生物导体版本：释放（3.18）

使用Illumina的450K或EPIC微阵列数据从人类基因组中识别预定义区域（启动子、CpG岛……）中的差异甲基化区域（DMR）。提供基于线性模型对CpG探针进行排序的方法，并包括绘图功能。

作者：Jordi Martorell-Marugán和Pedro Carmona-Sáez

维护人员：Jordi Martorell-Marugán<jmartorellm at gmail.com>

引文（从R中输入引文（“mCSEA”）):

要安装此软件包，请启动R（版本“4.3”）并输入：

如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.软件包（“BiocManager”）BiocManager:：安装（“mCSEA”）

对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.

要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：

浏览幻影（“mCSEA”）

生物视图	DNA甲基化,差异甲基化,表观遗传学,遗传学,基因组注释,免疫肿瘤学,甲基化阵列,微阵列,多重比较,软件,双通道
版本	1.22.0
在生物导体中	生物技术3.7（R-3.5）（6年）
许可证	GPL-2型
取决于	R（>=3.5），mCSEA数据,猿人
进口	生物反应器,fgsea公司,基因组特征,基因组范围，ggplot2，图形，grDevices，Gviz公司,I范围,利马，方法，并行，S4载体，统计，总结性实验，实用程序
系统要求
统一资源定位地址

建议	博科生物,生物遗传学,仿生风格,流式排序。血量450k、knitr、，白血病Eset,米菲,minfiData公司、rmarkdown、RUnit
链接到
增强功能
取决于我
导入我
建议我	神童（shinyepico）
链接到我
生成报告	生成报告

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包	mCSEA_1.22.0.tar.gz
Windows二进制	mCSEA_1.22.0.zip码
macOS二进制（x86_64）	mCSEA_1.22.0.tgz
macOS二进制（arm64）	mCSEA_1.22.0.tgz
源码库信息	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/mCSEA
源存储库（开发人员访问）	git克隆git@git.bioconductor.org：包/mCSEA
Bioc软件包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/mCSEA（网址：https://code.bioconductor.org/browse/mCSEA）/
包短Url	https://bioconductor.org/packages/mCSEA/
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