狮子座R

使用LIONESS为单个样本建模网络

生物导体版本：释放（3.18）

LIONESS或线性插值法可用于重建单样本网络(https://arxiv.org/abs/1505.06440). 此代码在R中的LIONESS函数中实现LIONESS方程，以重建单样本网络。我们使用的默认网络重建方法基于皮尔逊相关性。然而，lionessR可以在任何返回完整加权邻接矩阵的网络重建算法上运行。

作者：玛丽克·利迪亚·奎杰尔，谢平汉[cre]

维护人员：谢平汉（Ping-Han Hsieh）<dn070017，网址：gmail.com>

引文（从R中输入引文（“lionessR”）):

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“4.3”）并输入：

如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：安装（“lionessR”）

对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：

浏览幻影（“狮子座R”）

狮子座R	HTML格式	R脚本
参考手册	PDF格式
新闻	文本
许可证	文本

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细节

生物视图	基因表达式,网络,网络推理,软件
版本	1.16.0
在生物导体中	生物技术3.10（R-3.6）（4.5年）
许可证	MIT+文件许可证
取决于	R（>=3.6.0）
进口	统计数据，总结性实验,S4载体
系统要求
统一资源定位地址	https://github.com/mararie/lionessR
错误报告	https://github.com/mararie/lionessR/issues网站

建议	knitr、rmarkdown、igraph、reformate2、，利马
链接到
增强功能
取决于我
导入我
建议我
指向我的链接
生成报告	生成报告

程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包	狮子座R_1.16.0.tar.gz
Windows二进制	狮子座R_1.16.0.zip（仅64位）
macOS二进制（x86_64）	狮子座R_1.16.0.tgz
macOS二进制（arm64）	狮子座R_1.16.0.tgz
源码库信息	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/lionessR
源存储库（开发人员访问）	git克隆git@git.bioconductor.org：packages/lionessR
Bioc软件包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/lionessR/
包短Url	https://bioconductor.org/packages/lionessR/
软件包下载报告	下载统计信息