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列维

景观表达可视化界面


生物导体版本:释放(3.18)

该工具将来自生物网络的数据与转录组相结合,显示带有表面曲线的热图,以证明改变的区域。

作者:拉斐尔·皮兰[aut]、伊莎贝拉·席尔瓦[ctb]、艾格妮斯·武田[ctb]:Jose Rybarczyk Filho[ctb,cre,ths]

维护人员:Jose Luiz Rybarczyk Filho联合国教科文组织的Jose.Luiz

引文(从R中输入引文(“levi”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.3”)并输入:

if(!require(“生物管理器”,悄悄=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::安装(“levi”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文件

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览幻影(“levi”)
使用levi HTML格式 R脚本
参考手册 PDF格式
新闻 文本

细节

生物视图 基因表达式,网络,排序,软件
版本 1.20.0
在生物导体中 生物技术3.8(R-3.5)(5.5年)
许可证 GPL(>=2)
取决于
进口 DT(>=0.4)、RColorBrewer(>=1.1-2)、颜色空间(>=1.3-2)、dplyr(>=0.7.4)、ggplot2(>=2.2.1)、httr(>=1.3.1)、igraph(>=1.2.1),重塑2(>=1.4.3)、光泽(>=1.0.5)、闪亮仪表板(>=0.7.0)、闪耀js(>=1.0)、xml2(>=1.2.0)、knitr、Rcpp(>=0.12.18)、网格、grDevices、stats、utils、testtat、methods、rmark向下
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程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 列维_1.20.0.tar.gz
Windows二进制 列维_1.20.0.zip
macOS二进制(x86_64) 列维_1.20.0.tgz
macOS二进制(arm64) 列维_1.20.0.tgz
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/lev
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包裹/levi
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/levi/
程序包短Url https://bioconductor.org/packages/levi/
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