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希林夫

层次推理


生物导体版本:释放(3.18)

基于高维多变量(广义)线性模型对一个或多个研究/数据集进行分层推理的工具。一个可能的应用是对GWA研究进行分层推断,以在数据驱动的自动化程序中找到重要的组或单个SNP(如果信号较强)。该方法基于一种有效的分层多重测试校正并控制FWER。这些功能可以很容易地并行运行。

作者:Claude Renaux[aut,cre]、Laura Buzdugan[aut]、Markus Kalisch[aut]、Peter Bühlmann[aut]

维护人员:克劳德·雷诺<Renaux at stat.math.ethz.ch>

引文(从R中输入引文(“hierinf”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.3”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::安装(“hierinf”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览幻影(“hierinf”)
vignette-hierinf.Rnw PDF格式 R脚本
参考手册 PDF格式
新闻 文本
许可证 文本

细节

生物视图 群集基因组广泛协会链路不平衡回归SNP公司软件
版本 1.20.0年
在生物导体中 生物技术3.8(R-3.5)(5.5年)
许可证 GPL-3|文件许可证
取决于 R(>=3.6.0)
进口 fmsb,glmnet,方法,并行,统计
系统要求
统一资源定位地址
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建议 knitr、MASS、testhat
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程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 等级1.20.0.tar.gz
Windows二进制 hierinf_1.20.0.zip码
macOS二进制(x86_64) 等级_1.20.0.tgz
macOS二进制(arm64) 等级_1.20.0.tgz
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/hierinf
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:程序包/hierinf
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/hierinf/
包短Url https://bioconductor.org/packages/hierinf/
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