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h5vc公司

使用hdf5后端管理校准计数


生物导体版本:释放(3.18)

该软件包包含与存储在HDF5文件中的NGS实验计数数据交互的功能。

作者:保罗·西奥多·派尔

维护人员:保罗·西奥多·派尔(Paul Theodor Pyl)<Paul.Theodor.Pyl at gmail.com>

引文(从R中输入引文(“h5vc”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.3”)并输入:

if(!require(“生物管理器”,悄悄=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::安装(“h5vc”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文件

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览幻影(“h5vc”)
用h5vc和shiwn构建一个最小的基因组浏览器 HTML格式 R脚本
h5vc—巡视 HTML格式 R脚本
参考手册 PDF格式

细节

生物视图 软件
版本 2.36.0
在生物导体中 生物技术2.13(R-3.0)(10.5年)
许可证 GPL(>=3)
取决于 网格、gridExtra、ggplot2
进口 rhdf5型、重塑、,S4载体,I范围,生物串,Rsamtools软件(>=2.13.1),方法,基因组范围、abind、,生物并行、批处理作业、,h5vc数据,基因组信息Db
系统要求 GNU品牌
统一资源定位地址
查看更多
建议 knitr、locfit、,英国基因组。哈皮恩斯。加州大学圣保罗分校hg19,生物反应器,英国基因组。哈皮恩斯。NCBI。GRCh38型、RUnit、,生物遗传学、rmarkdown
链接到 Rhtslib公司(>= 1.99.1)
增强功能
取决于我
导入我
建议我 h5vc数据
指向我的链接
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程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 h5vc_2.36.0.tar.gz型
Windows二进制 h5vc_2.36.0.zip型(仅64位)
macOS二进制(x86_64) h5vc_2.36.0.tgz型
macOS二进制(arm64) h5vc_2.36.0.tgz型
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/h5vc
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/h5vc
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/h5vc/
包短Url https://bioconductor.org/packages/h5vc/
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