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格特里斯

基因组水平网格布局


生物导体版本:释放(3.18)

基因组水平网格图显示了由基因组类别(例如染色体)调节的基因组数据。对于每个基因组类别,以轨迹表示的多维数据描述了来自不同方面的不同特征。该软件包提供了高度的灵活性,可以安排基因组类别并在绘图中添加自定义图形。

作者:祖光顾[aut,cre]

维护人员:祖光顾<z.Gu at dkfz.de>

引文(从R中输入引文(“gtrellis”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.3”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::install(“gtrellis”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览幻影(“gtrellis”)
制作基因组级网格图 HTML格式 R脚本
参考手册 PDF格式
新闻 文本
许可证 文本

细节

生物视图 排序,软件,可视化
版本 1.34.0
在生物导体中 生物技术3.1(R-3.2)(9年)
许可证 MIT+文件许可证
取决于 R(>=3.1.2),网格,I范围,基因组范围
进口 循环(>=0.4.8),GetoptLong,grDevices,utils
系统要求
统一资源定位地址 https://github.com/jokergoo/gtrellis网站
查看更多
建议 测试(>=1.0.0)、knitr、RColorBrewer、markdown、rmarkdown、,复杂热图(>=1.99.0),开罗,png,jpeg,tiff
链接到
增强功能
取决于我
导入我 雅加达
建议我
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程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 gtrellis_1.34.0.tar.gz
Windows二进制 gtrellis_1.34.0.zip格式
macOS二进制(x86_64) gtrellis_1.34.0.tgz
macOS二进制(arm64) gtrellis_1.34.0.tgz
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/gtrellis网站
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包装/gtrellis
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/gtrellis网站/
包短Url https://bioconductor.org/packages/gtrellis网站/
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