石膏

基因特异性表型估计

生物导体版本：释放（3.18）

从非目标混淆RNAi筛选中估计基因特异性表型。利用正则化线性回归模型，基于靶向和非靶向基因对每个siRNA的表型进行建模。

作者：费比安·施密奇

维护人员：费比安·施密奇（Fabian Schmich）<Fabian.Schmich at bsse.ethz.ch>

引文（从R中输入引文（“gespeR”）):

要安装此软件包，请启动R（版本“4.3”）并输入：

如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：安装（“gespeR”）

对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.

要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：

浏览幻影（“gespeR”）

反卷积离目标干扰RNAi屏幕的R包	PDF格式	R脚本
参考手册	PDF格式

生物视图	基于细胞的分析,基因目标,免疫肿瘤学,预处理,回归,软件,可视化
版本	1.34.0
在生物导体中	生物技术3.1（R-3.2）（9年）
许可证	GPL-3公司
取决于	方法，图形，ggplot2，R（>=2.10）
进口	矩阵，glmnet，单元格HTS2,博科生物,生物反应器，do并行，并行，foreach，重塑2，dplyr
系统要求
统一资源定位地址	http://www.cbg.ethz.ch/software/gespeR

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包	石膏R_1.34.0.tar.gz
Windows二进制	gespeR_1.34.0.zip型
macOS二进制（x86_64）	石膏R_1.34.0.tgz
macOS二进制（arm64）	石膏R_1.34.0.tgz
源码库信息	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/gespeR
源存储库（开发人员访问）	git克隆git@git.bioconductor.org：packages/gespeR
Bioc软件包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/gespeR/
包短Url	https://bioconductor.org/packages/gespeR/
软件包下载报告	下载统计信息