gep2pep基因

路径表达谱（PEP）的创建和分析

生物导体版本：释放（3.18）

路径表达谱（PEP）基于路径（定义为一组基因）的表达，而不是单个基因的表达。该软件包将基因表达谱转换为PEP，并对路径和实验条件进行富集分析，例如分别进行“药物集富集分析”和“基因2药物”药物发现分析。

作者：弗朗西斯科·纳波利塔诺（Francesco Napolitano）<franapoli at gmail.com>

维护人员：弗朗西斯科·纳波利塔诺（Francesco Napolitano）<franapoli at gmail.com>

引文（从R中输入引文（“gep2pep”）):

要安装此软件包，请启动R（版本“4.3”）并输入：

如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.软件包（“BiocManager”）BiocManager:：安装（“gep2pep”）

对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.

要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：

浏览幻影（“gep2pep”）

生物视图	差异表达式,尺寸缩减,去,基因表达式,GeneSet扩展,路径,软件
版本	1.22.0
在生物导体中	生物技术3.7（R-3.5）（6年）
许可证	GPL-3型
取决于
进口	回购（>=2.1.1），foreach，stats，utils，GSEA基地、方法、，博科生物、XML、，rhdf5型、摘要、迭代器
系统要求
统一资源定位地址

建议	WriteXLS、testhat、knitr、rmarkdown
链接到
增强功能
取决于我
导入我
建议我
链接到我
生成报告	生成报告

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包	gep2pep_1.22.0.tar.gz型
Windows二进制	gep2pep_1.22.0.zip
macOS二进制（x86_64）	gep2pep_1.22.0.tgz
macOS二进制（arm64）	gep2pep_1.22.0.tgz
源码库信息	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/gep2pep
源存储库（开发人员访问）	git克隆git@git.bioconductor.org：packages/gep2pep
Bioc软件包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/gep2pep/
包短Url	https://bioconductor.org/packages/gep2pep/
软件包下载报告	下载统计信息