注册并公开摘要对于生物2024

gcatest公司

基因型条件关联试验


生物导体版本:释放(3.18)

GCAT是一种用于全基因组关联研究的关联测试,用于控制一般性状模型下的种群结构。这项测试以特性为条件,使其不受未建模环境因素的干扰。人口结构通过使用“lfa”包估计的逻辑因子进行建模。

作者:魏浩[aut],宋敏孙[aut]Alejandro Ochoa[aut,cre],约翰·斯托里

维护人员:亚历杭德罗·奥乔亚(Alejandro Ochoa)

引文(从R中输入引文(“gcatest”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.3”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::install(“gcatest”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览幻影(“gcatest”)
gcat包 PDF格式 R脚本
参考手册 PDF格式
新闻 文本

细节

生物视图 尺寸缩减,基因组广泛协会,主要组件,SNP公司,软件
版本 2.2.0
在生物导体中 生物技术3.2(R-3.2)(8.5年)
许可证 GPL(>=3)
取决于 R(>=4.0)
进口 方法,低频放大器
系统要求
统一资源定位地址 https://github.com/StoreyLab/gcatest网站
错误报告 https://github.com/StoreyLab/gcatest/issues
查看更多
建议 knitr、ggplot2、testtat、BED矩阵、genio
链接到
增强功能
取决于我
导入我
建议我
指向我的链接
生成报告 生成报告

程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 通用条款_2.2.0.tar.gz
Windows二进制 gcatest_2.2.0.zip文件
macOS二进制(x86_64) gcatest_2.2.0.tgz
macOS二进制(arm64) gcatest_2.2.0.tgz
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/gcatest网址
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/gcatest
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/gcatest网站/
包短Url https://bioconductor.org/packages/gcatest/
软件包下载报告 下载统计信息