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fcoex公司

这个包裹是已弃用。很可能从Bioconductor中移除。请参阅这个成套设备寿命终止指南了解更多信息。

此软件包适用于3.18版的Bioconductor。此包已从Bioconductor中删除。有关最新的稳定版本,请参阅fcoex公司.

基于FCBF的单细胞共表达网络


生物导体版本:释放(3.18)

fcoex包基于FCBF(Fast Correlation-based Filter)算法实现了一个易于使用的接口到联合表达式分析。它是专门为处理单细胞数据而实现的。所发现的模块可用于重新定义细胞群体,消除新的基因关联,并通过关联预测基因功能。包结构是根据CEMiTool包改编而来的,依赖于CEMiTool作者设计和编写的可视化和代码。

作者:蒂亚戈·卢比亚纳〔aut,cre〕,赫尔德·纳卡亚〔aut,ths〕

维护人员:蒂亚戈·卢比亚纳(Tiago Lubiana)<Tiago.Lubiana.alves at usp.br>

引文(从R中输入引文(“fcoex”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.3”)并输入:

if(!require(“生物管理器”,悄悄=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::install(“fcoex”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文件

参考手册 PDF格式

细节

生物视图 基因表达式,图形和网络,免疫肿瘤学,网络,网络丰富,路径,RNA序列,单个单元格,软件,转录组学,mRNA微阵列
版本 1.16.0
在生物导体中 生物技术3.10(R-3.6)(4.5年)
许可证 GPL-3公司
取决于 R(>=4.1)
进口 燃料电池断路器,并行,进程,dplyr,ggplot2,ggexit,igraph,网格,integraph,stringr,集群探查器,data.table,grDevices,方法,网络,规模,sna,utils,stats,单细胞实验,路径PCA,矩阵
系统要求
统一资源定位地址
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建议 测试(>=2.1.0)、开发工具、BiocManager、,TENxPBMC数据,散射,附表,网格额外,尖叫声、修拉、尼特尔、玛尔卡多恩
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程序包档案

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源程序包
Windows二进制
macOS二进制(x86_64)
macOS二进制(arm64)
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/fcoex网站
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/fcoex
包短Url https://bioconductor.org/packages/fcoex网站/
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