边缘

差异基因表达的提取

生物导体版本：释放（3.18）

edge软件包实现了对全基因组基因表达研究进行差异表达分析的方法。对一般研究设计实施了使用最优发现程序和广义似然比检验（相当于F检验和t检验）的显著性检验。可以使用特殊功能来帮助分析常见的研究设计，包括时程实验。其他软件包（如snm、sva和qvalue）集成在edge中，为基因表达分析提供了广泛的工具。

作者：John D.Storey、Jeffrey T.Leek和Andrew J.Bass

维护人员：约翰·D·斯托里（John D.Storey）、安德鲁·巴斯（Andrew J.Bass）、埃莫里·埃杜（emory.edu）

引文（从R中输入引文（“边缘”）):

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“4.3”）并输入：

如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：安装（“边缘”）

对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：

浏览Vignette（“边缘”）

边缘包	PDF格式	R脚本
参考手册	PDF格式
新闻	文本
许可证	文本

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细节

生物视图	数据导入,差异表达式,基因表达式,多重比较,回归,软件,时间课程
版本	2.34.0
在生物导体中	生物技术3.1（R-3.2）（9年）
许可证	MIT+文件许可证
取决于	R（>=3.1.0），博科生物
进口	方法、样条曲线、，特别行政区,信噪比,q值（>=1.99.0），质量
系统要求
统一资源定位地址	https://github.com/jdstorey/edge
错误报告	https://github.com/jdstorey/edge/issues

建议	测试，编织器，ggplot2，重新绘制2
链接到
增强功能
取决于我
导入我
建议我
指向我的链接
生成报告	生成报告

程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包	边缘_2.34.0.tar.gz
Windows二进制	边缘_2.34.0.zip（仅限64位）
macOS二进制（x86_64）	边缘_2.34.0.tgz
macOS二进制（arm64）	边缘_2.34.0.tgz
源码库信息	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/edge网站
源存储库（开发人员访问）	git克隆git@git.bioconductor.org：包装/边缘
Bioc软件包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/edge/
包短Url	https://bioconductor.org/packages/edge网站/
软件包下载报告	下载统计信息