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差异统计信息

生物网络上的扩散分数


生物导体版本:释放(3.18)

标记传播方法是计算生物学中广泛使用的一种程序,用于使用网络数据为分子实体提供上下文。节点标签可以从基因表达、全基因组关联研究、蛋白质域或代谢组学分析中获得,并传播到网络中的邻居,通过事先注释的知识有效地平滑分数,并优先考虑新的候选对象。R包diffuStats包含一组扩散内核和评分方法,有助于其计算、特征描述和基准测试。

作者:塞尔吉奥·皮卡特·阿尔马达[aut,cre],亚历山大·佩雷拉·卢纳[aut]

维护人员:塞尔吉奥·皮卡特·阿尔马达(Sergio Picart-Armada)

引文(从R中输入引文(“diffuStats”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.3”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::install(“diffuStats”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览渐晕图(“diffuStats”)
案例研究:预测蛋白质功能 PDF格式 R脚本
快速入门 HTML格式 R脚本
参考手册 PDF格式
新闻 文本

细节

生物视图 基因表达式,遗传学,基因组广泛协会,图形和网络,代谢组学,网络,规范化,蛋白质组学,软件,转录组学
版本 1.22.0
在生物导体中 生物技术3.6(R-3.4)(6.5年)
许可证 GPL-3公司
取决于 R(>=3.4)
进口 grDevices、stats、methods、Matrix、MASS、checkmate、expm、igraph、Rcpp、RcppArmadillo、Rcpp-Parallel、plyr、precrec
系统要求 GNU品牌
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程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 差异统计_1.22.0.tar.gz
Windows二进制 diffuStats_1.22.0.zip
macOS二进制(x86_64) diffuStats_1.22.0.tgz
macOS二进制(arm64) diffuStats_1.22.0.tgz
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/diffuStats网站
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/diffuStats
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/diffuStats网站/
包短Url https://bioconductor.org/packages/diffuStats网站/
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