增量捕获C

该软件包从3C数据中发现中尺度染色质重塑

生物导体版本：释放（3.18）

该软件包从3C数据中发现中尺度染色质重塑。3C数据本质上是本地的。它给出了限制性内切酶消化片段和首选“视点”区域之间的相互作用计数。通过将这些数据装箱并使用排列测试，该软件包可以测试两种细胞类型或两种处理的数据之间的相互作用计数是否存在统计上显著的变化。

作者：迈克尔·夏皮罗

维护人员：迈克尔·夏皮罗（Michael Shapiro）<Michael.Shapiro at crick.ac.uk>

引文（从R中输入引文（“deltaCaptureC”）):

要安装此软件包，请启动R（版本“4.3”）并输入：

if（！require（“生物管理器”，悄悄=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：安装（“deltaCaptureC”）

对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.

要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：

浏览渐晕图（“deltaCaptureC”）

生物视图	生物学问题,软件,统计方法
版本	1.16.1
在生物导体中	生物技术3.10（R-3.6）（4.5年）
许可证	MIT+文件许可证
取决于	R（>=3.6）
进口	I范围,基因组范围,总结性实验，ggplot2，DESeq2公司、tictoc
系统要求
统一资源定位地址

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包	增量捕获C_1.16.1.tar.gz
Windows二进制	增量捕获C_1.16.1.zip
macOS二进制（x86_64）	增量捕获C_1.16.1.tgz
macOS二进制（arm64）	增量捕获C_1.16.1.tgz
源码库信息	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/deltaCaptureC
源存储库（开发人员访问）	git克隆git@git.bioconductor.org：包/deltaCaptureC
Bioc软件包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/deltaCaptureC网站/
程序包短Url	https://bioconductor.org/packages/deltaCaptureC/
软件包下载报告	下载统计信息
BioC 3.18的旧源程序包	源存档