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塞拉夫

参考单细胞RNAseq细胞簇标记


生物导体版本:释放(3.18)

在单细胞RNAseq实验的聚类步骤之后,该软件包旨在根据与参考数据集的相似性,为聚类建议标签/细胞类型。它需要每个基因每个细胞的读取计数表,以及属于每个簇的细胞列表(用于测试数据和参考数据)。

作者:莎拉·威廉姆斯

维护人员:萨拉·威廉姆斯(Sarah Williams)<萨拉·威廉斯(Sarah.williams1 at monash.edu>

引文(从R中输入引文(“celaref”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.3”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.软件包(“BiocManager”)BiocManager::install(“celaref”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览幻影(“celaref”)
手动 HTML格式 R脚本
参考手册 PDF格式
新闻 文本

细节

生物视图 单个单元格,软件
版本 1.20.0
在生物导体中 生物技术3.8(R-3.5)(5.5年)
许可证 GPL-3公司
取决于 R(>=3.5.0),总结性实验
进口 桅杆,ggplot2,矩阵,dplyr,magrittr,stats,utils,rlang,生物遗传学,S4矢量,读卡器,易读,DelayedArray(延迟阵列)
系统要求
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程序包档案

跟随安装在您的R会话中使用此软件包的说明。

源程序包 塞拉雷_1.20.0.tar.gz
Windows二进制 celaref1.20.0.zip码
macOS二进制(x86_64) 摄氏度_1.20.0.tgz
macOS二进制(arm64) 摄氏度_1.20.0.tgz
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/celaref
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/celaref
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/celaref/
包短Url https://bioconductor.org/packages/celaref/
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