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分支指针

内含子剪接支点的预测


生物导体版本:释放(3.18)

预测内含子分支点窗口中站点的分支点概率。查询可以作为内部区域提供;或评估突变、SNP的影响。

作者:Beth信号

维护人员:Beth Signal<b.Signal在garvan.org.au>

引文(从R中输入引文(“分支指针”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.3”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::install(“分支指针”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览幻影(“分支指针”)
使用Branchpointer注释内含子人类剪接分支点 PDF格式 R脚本
参考手册 PDF格式
新闻 文本
许可证 文本

细节

生物视图 基因组注释,基因组变异,Motif注释,软件
版本 1.28.0
在生物导体中 生物活性炭3.5(R-3.4)(7年)
许可证 BSD_3_clause+文件许可证
取决于 插入符号,R(>=3.4)
进口 plyr、kernlab、gbm、stringr、cowplot、ggplot2、,生物电阻,生物串,并行,utils,stats,英国基因组。哈皮恩斯。加州大学旧金山分校hg38,rtracklayer公司,基因组范围,基因组信息Db,I范围,S4载体,数据表
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程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 分支指针_1.28.0.tar.gz
Windows二进制 分支指针_1.28.0.zip
macOS二进制(x86_64) 分支指针_1.28.0.tgz
macOS二进制(arm64) 分支指针_1.28.0.tgz
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/branchpointer网站
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:程序包/分支指针
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/branchpointer网站/
包短Url https://bioconductor.org/packages/branchpointer网站/
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