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浮雕

用于在检测器(珠)水平上对Illumina微阵列进行预处理和分析的工具


生物导体版本:释放(3.18)

封装blima包括用于Illumina微阵列数据预处理的若干算法。它专注于珠级分析,并为不等长度向量的分位数归一化提供了新的方法。它提供了多种背景校正方法,包括背景减法、类RMA卷积和背景异常值去除。它还实现了珠级的方差稳定转换。也有数据汇总的实现方法。它还提供了在检测器(珠子)水平和差异表达测试的探针水平上执行T测试的方法。

作者:Vojtěch Kulvait公司

维护人员:Vojtěch Kulvait<Kulvait at gmail.com>

引文(从R中输入引文(“blima”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.3”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.软件包(“BiocManager”)BiocManager::安装(“blima”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览幻影(“blima”)
blima.pdf文件 PDF格式 R脚本
参考手册 PDF格式
新闻 文本

细节

生物视图 差异表达式,基因表达式,基因调控,微阵列,规范化,预处理,软件
版本 1.36.0
在生物导体中 生物技术3.0(R-3.1)(9.5年)
许可证 GPL-3公司
取决于 R(>=3.3)
进口 beadarray公司(>= 2.0.0),博科生物(>=2.0.0),Rcpp(>=0.12.8),生物遗传学,gr设备,统计,图形
系统要求
统一资源定位地址 https://bitbucket.org/kulvait/blima网站
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程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 闪电战_1.36.0.tar.gz
Windows二进制 blima_1.36.0.zip
macOS二进制(x86_64) blima_1.36.0.tgz
macOS二进制(arm64) blima_1.36.0.tgz
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/blima网站
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:程序包/blima
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/blima网址/
包短Url https://bioconductor.org/packages/blima网站/
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