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培根

利用经验零分布控制关联研究中的偏差和通货膨胀


生物导体版本:释放(3.18)

培根可以用来消除表观基因组和转录组关联研究中经常观察到的膨胀和偏见。为此,培根使用吉布斯采样算法,通过在z分数上拟合三分量正态混合物,构建了一个经验零分布。

作者:马滕·范·伊特森[aut,cre],埃里克·范·兹维特[ctb]

维护人员:马滕·范·伊特森(Maarten van Iterson)<mviterson at gmail.com>

引文(从R中输入引文(“培根”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.3”)并输入:

if(!require(“生物管理器”,悄悄=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::安装(“培根”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览幻影(“培根”)
使用经验零分布控制关联研究中的偏差和通货膨胀 HTML格式 R脚本
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新闻 文本

细节

生物视图 BatchEffect(批次效果),贝叶斯主义者,基因组广泛协会,免疫肿瘤学,甲基化阵列,多重比较,RNA序列,回归,软件,统计方法,转录组学
版本 1.30.0
在生物导体中 生物多样性3.3(R-3.3)(8年)
许可证 GPL(>=2)
取决于 R(>=3.3),方法,统计,ggplot2,图形,生物并行,椭圆
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程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 培根1.30.0.tar.gz
Windows二进制 bacon_1.30.0.zip(仅64位)
macOS二进制(x86_64) bacon_1.30.0.tgz
macOS二进制(arm64) bacon_1.30.0.tgz
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/培根
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包装/培根
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/backon/
程序包短Url https://bioconductor.org/packages/bacon网站/
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