绝对值R

抗体库Rep-Seq数据集的报告和数据分析功能

生物导体版本：发布（3.18）

AbSeq是用于分析抗体库生成的测序数据集的综合生物信息管道，abseqR是其软件包之一。abseqR授权abseqPy的用户(https://github.com/malhamdoosh/abseqPy)具有绘图和报告功能，并允许他们生成交互式HTML报告，以便与其他研究人员查看和共享。此外，abseqR扩展了abseqPy，以比较多个曲目分析，并对其输出执行进一步的下游分析。

作者：JiaHong Fong[cre，aut]、Monther Alhamdoosh[aut]

维护人员：JiaHong Fong在gmail.com>上的jiahfong

引文（从R中输入引文（“abseqR”）):

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“4.3”）并输入：

如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：安装（“abseqR”）

对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：

浏览渐晕图（“abseqR”）

abseqR简介	PDF格式	R脚本
参考手册	PDF格式
新闻	文本
许可证	文本

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细节

生物视图	多重比较,质量控制,报告写作,排序,软件,可视化
版本	1.20.0
在生物导体中	生物技术3.8（R-3.5）（5.5年）
许可证	GPL-3\|文件许可证
取决于	R（>=3.5.0）
进口	ggplot2、RColorBrewer、旋转、重塑2、维恩图、plyr、flexdashboard、，生物并行（>=1.1.25）、png、grid、gridExtra、rmarkdown、knitr、vegan、ggcorrplot、ggdendro、plotly、，仿生风格、stringr、utils、methods、grDevices、stats、tools、graphics
系统要求	潘多克（>=1.19.2.1）
统一资源定位地址	https://github.com/malhamdoosh/abseqR
错误报告	https://github.com/malhamdoosh/abseqR/issues

建议	测试那个
链接到
增强功能
取决于我
导入我
建议我
指向我的链接
生成报告	生成报告

程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包	下降R_1.20.0.tar.gz
Windows二进制	abseqR_1.20.0.zip格式
macOS二进制（x86_64）	绝对值R_1.20.0.tgz
macOS二进制（arm64）	下降R_1.20.0.tgz
源码库信息	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/abseqR
源存储库（开发人员访问）	git克隆git@git.bioconductor.org：包裹/缺勤
Bioc软件包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/abseqR/
包短Url	https://bioconductor.org/packages/abseqR/
软件包下载报告	下载统计信息