躯体特征

生物导体版本：释放（3.18）

SomaticSignatures软件包识别单核苷酸变体（SNV）的突变特征。它提供了与Nik-Zainal（2012，Cell）所述方法相关的基础设施，矩阵分解算法具有灵活性。

作者：朱利安·盖林

维护人员：朱利安·格林（Julian Gehring）<jg-bico at gmx.com>

引文（从R中输入引文（“体征”）):

要安装此软件包，请启动R（版本“4.3”）并输入：

如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.软件包（“BiocManager”）BiocManager:：install（“躯体签名”）

对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.

要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：

浏览幻影（“身体特征”）

生物视图	群集,基因组变异,排序,软件,体细胞突变,统计方法,可视化
版本	2.38.0
在生物导体中	生物技术2.14（R-3.1）（10年）
许可证	MIT+文件许可证
取决于	R（>=3.5.0），变量注释,基因组学范围，国家货币基金组织
进口	S4矢量,I范围,基因组信息Db,生物串，ggplot2，ggbio公司，重塑2，NMF，pca方法,博科生物，方法，代理
系统要求
统一资源定位地址	https://github.com/juliangehring/SomaticSignatures网站
错误报告	https://support.bioconductor.org

建议	测试，knitr，平行，英国基因组。Hsapiens.1000基因组.hs37d5,躯体癌改变、ggdendro、fastICA、，特别行政区
链接到
增强功能
取决于我
导入我	雅加达
建议我
指向我的链接
生成报告	生成报告

跟随安装在您的R会话中使用此软件包的说明。

源程序包	躯体签名_2.38.0.tar.gz
Windows二进制	躯体签名_2.38.0.zip
macOS二进制（x86_64）	身体特征_2.38.0.tgz
macOS二进制（arm64）
源码库信息	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/SomaticSignatures（https://git.bioconductor.org/packages/SomaticSignatures）
源存储库（开发人员访问）	git克隆git@git.bioconductor.org：包/体签名
Bioc软件包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/SomaticSignatures网站/
包短Url	https://bioconductor.org/packages/SomaticSignatures网站/
软件包下载报告	下载统计信息