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SeqVarTools(序列变量工具)

变量数据工具


生物导体版本:释放(3.18)

SeqArray中提供的VCF数据快速存取存储格式的接口,带有用于常见操作和分析的工具。

作者:斯蒂芬妮·戈加滕(Stephanie M.Gogarten)、郑秀文(Xiuwen Zheng)、阿德里安·斯蒂尔普(Adrienne Stilp)

维护人员:斯蒂芬妮·戈加滕(Stephanie M.Gogarten)

引文(从R中输入引文(“SeqVarTools”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.3”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.软件包(“BiocManager”)BiocManager::安装(“SeqVarTools”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览渐晕图(“SeqVarTools”)
SeqVarTools简介 PDF格式 R脚本
SeqVarTools中的迭代器 PDF格式 R脚本
参考手册 PDF格式
新闻 文本

细节

生物视图 遗传变异性,遗传学,SNP公司,排序,软件
版本 1.40.0
在生物导体中 生物C 2.13(R-3.0)(10.5岁)
许可证 GPL-3公司
取决于 SeqArray(序列阵列)
进口 gr设备、图形、统计、方法,博科生物,生物遗传学,gdsfmt公司,基因组学范围,I范围,S4矢量,GWASExactHW,logistf,矩阵,数据表
系统要求
统一资源定位地址 https://github.com/smgogarten/SeqVarTools网站
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建议我 GMMAT,马吉
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程序包档案

跟随安装在您的R会话中使用此软件包的说明。

源程序包 序列变量工具_1.40.0.tar.gz
Windows二进制 SeqVarTools_1.40.0.zip(仅64位)
macOS二进制(x86_64) SeqVarTools_1.40.0.tgz序列变量工具
macOS二进制(arm64) 序列变量工具_1.40.0.tgz
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/SeqVarTools网站
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/SeqVarTools
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/SeqVarTools网站/
包短Url https://bioconductor.org/packages/SeqVarTools网站/
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