RTCGA公司
癌症基因组图谱数据集成
生物导体版本:释放(3.18)
癌症基因组图谱(TCGA)数据门户为研究人员搜索、下载和分析TCGA生成的数据集提供了一个平台。它包含临床信息、基因组特征数据和肿瘤基因组的高级序列分析。关键是了解基因组学以改进癌症护理。RTCGA软件包使用患者条形码密钥提供TCGA数据的种类和数量的下载和集成,使数据更容易获得。这可能会对科学发展和患者治疗的改进产生有益影响。此外,RTCGA包还将TCGA数据转换为便于使用的整洁形式。
作者:马金·科辛斯基[aut,cre],普尔泽米斯拉夫·比切克[ctb],维托尔德·乔多[ctb]
维护人员:马金·科辛斯基(Marcin Kosinski)<m.p.Kosinski at gmail.com>
安装
要安装此软件包,请启动R(版本“4.3”)并输入:
if(!require(“生物管理器”,悄悄=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::安装(“RTCGA”)
对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.
文件
要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:
浏览渐晕图(“RTCGA”)
细节
查看更多
建议 |
devtools、testtat、pander、,博科生物,基因组范围,I范围,S4载体,RTCGA.rnaseq公司,RTCGA.临床,RTCGA.突变,RTCGA公司。RPPA公司,RTCGA.mRNA,RTCGA.miRNA序列,RTCGA.甲基化,RTCGA公司。CNV公司、magrittr、tidyr |
链接到 |
|
增强功能 |
|
取决于我 |
RTCGA.临床,RTCGA公司。CNV公司,RTCGA.甲基化,RTCGA.miRNA序列,RTCGA.mRNA,RTCGA.突变,RTCGA公司。PANCAN12公司,RTCGA.rnaseq公司,RTCGA公司。RPPA公司 |
导入我 |
基于TD的UFEadv |
建议我 |
|
指向我的链接 |
|
生成报告 |
生成报告 |
程序包档案
跟随安装在R会话中使用此包的说明。