RLassoCox公司

整合基因相互作用信息的重加权Lasso-Cox

生物导体版本：释放（3.18）

RLasso-Cox是一个实现刘伟提出的RLasso-Cox模型的软件包。RLasso-Box模型将基因相互作用信息集成到Lasso-Box模式中，以实现准确的生存预测和生存生物标志物发现。它基于这样一个假设，即基因相互作用网络中拓扑重要的基因往往具有稳定的表达变化。RLasso-Box模型使用随机行走来评估基因的拓扑权重，然后突出拓扑重要的基因，以提高Lasso-Box模式的泛化能力。RLasso-Box模型具有在独立数据集上识别具有高预后性能的小基因集的优势，这可能在识别各种癌症类型的稳健生存生物标记物方面发挥重要作用。

作者：刘伟[cre，aut]

维护人员：刘伟（Wei Liu）<freelw at qq.com>

引文（从R中输入引文（“RLassoCox”）):

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“4.3”）并输入：

如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：安装（“RLassoCox”）

对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：

浏览渐晕图（“RLassoCox”）

RLassoCox公司	PDF格式	R脚本
参考手册	PDF格式
新闻	文本

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细节

生物视图	基因表达式,基因预测,网络,回归,软件,生存
版本	1.10.0
在生物导体中	生物化学3.13（R-4.1）（3年）
许可证	艺术-2.0
取决于	R（>=4.1），glmnet
进口	矩阵、迁徙、生存、统计
系统要求
统一资源定位地址
错误报告	https://github.com/weiliu123/RLassoCox/issues

建议	针织者
链接到
增强
取决于我
导入我
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生成报告	生成报告

程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包	RLassoCox_1.10.0.tar.gz公司
Windows二进制	RLassoCox_1.10.0.zip公司
macOS二进制（x86_64）	RLassoCox_1.10.0.tgz公司
macOS二进制（arm64）	RLassoCox_1.10.0.tgz公司
源码库信息	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/RLassoCox
源存储库（开发人员访问）	git克隆git@git.bioconductor.org：包/RLassoCox
Bioc软件包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/RLassoCox网站/
包短Url	https://bioconductor.org/packages/RLassoCox网站/
软件包下载报告	下载统计信息