PhenoGeneRanker公司

PhenoGeneRanker：基因和表型优先化工具

生物导体版本：释放（3.18）

该软件包是一个利用多重异质基因-表型网络的基因/表型优先化工具。PhenoGeneRanker允许多层基因和表型网络。它还根据基因/表型在网络中的连通度，使用基因/表型的随机分层抽样计算基因/表型排名的经验p值。https://dl.acm.org/doi/10.1145/3307339.3342155。

作者：Cagatay Dursun【aut，cre】

维护人员：Cagatay Dursun<cagataydursun at gmail.com>

引文（从R中输入引文（“PhenoGeneRanker”）):

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“4.3”）并输入：

如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：安装（“PhenoGeneRanker”）

对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：

浏览幻影（“PhenoGeneRanker”）

PhenoGeneRanker公司	HTML格式	R脚本
参考手册	PDF格式
新闻	文本

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细节

生物视图	生物医学信息学,基因预测,图形和网络,网络,网络推理,路径,软件,系统生物学
版本	1.10.0
在生物导体中	生物化学3.13（R-4.1）（3年）
许可证	Creative Commons Attribution 4.0国际许可
取决于
进口	igraph、Matrix、foreach、doParallel、dplyr、stats、utils、parallel
系统要求
统一资源定位地址

建议	knitr、rmarkdown
链接到
增强功能
取决于我
导入我
建议我
指向我的链接
生成报告	生成报告

程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包	PhenoGeneRanker_1.10.0.tar.gz公司
Windows二进制	PhenoGeneRanker_1.10.0.zip公司
macOS二进制（x86_64）	PhenoGeneRanker_1.10.0.tgz公司
macOS二进制（arm64）	PhenoGeneRanker_1.10.0.tgz公司
源码库信息	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/PhenoGeneRanker网站
源存储库（开发人员访问）	git克隆git@git.bioconductor.org：软件包/PhenoGeneRanker
Bioc软件包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/PhenoGeneRanker网站/
包短Url	https://bioconductor.org/packages/PhenoGeneRanker网站/
软件包下载报告	下载统计信息